Кристаллическая структура комплекса α-тромбина человека с гемадином: ингибитор, связывающийся с экзосайтом II
Crystal structure of the human alpha-thrombin-haemadin complex: an exosite II-binding inhibitor
Рентгеноструктурное исследование в журнале The EMBO journal (2000)
Аннотация
The serine proteinase alpha-thrombin plays a pivotal role in the regulation of blood fluidity, and therefore constitutes a primary target in the treatment of various haemostatic disorders. Haemadin is a slow tight- binding thrombin inhibitor from the land-living leech Haemadipsa sylvestris. Here we present the 3.1 A crystal structure of the human alpha-thrombin- haemadin complex. The N-terminal segment of haemadin binds to the active site of thrombin, forming a parallel beta-strand with residues Ser214-Gly216 of the proteinase. This mode of binding is similar to that observed in another leech-derived inhibitor, hirudin. In contrast to hirudin, however, the markedly acidic C-terminal peptide of haemadin does not bind the fibrinogen-recognition exosite, but interacts with the heparin-binding exosite of thrombin. Thus, haemadin binds to thrombin according to a novel mechanism, despite an overall structural similarity with hirudin. Haemadin inhibits both free and thrombomodulin-bound alpha-thrombin, but not intermediate activation forms such as meizothrombin. This specific anticoagulant ability of haemadin makes it an ideal candidate for an antithrombotic agent, as well as a starting point for the design of novel antithrombotics.
Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.
Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.
Резюме
Гемадин — медленно и прочно связывающийся ингибитор тромбина из наземной пиявки Haemadipsa sylvestris, чья кристаллическая структура в комплексе с человеческим α-тромбином представлена с разрешением 3,1 Å. N-концевой сегмент гемадина занимает активный центр тромбина, формируя параллельную β-цепь с остатками Ser214–Gly216, что напоминает связывание гирудина. Однако выраженно кислый С-концевой пептид гемадина взаимодействует не с экзосайтом распознавания фибриногена, а с гепарин-связывающим экзосайтом. Гемадин ингибирует свободный и связанный с тромбомодулином α-тромбин, но не мейзотромбин, что делает его кандидатом для создания новых антитромботических средств.
Почему это важно для гирудотерапии
С помощью рентгеноструктурного анализа в этом исследовании была разрешена структура с разрешением 3,1 ангстрема человеческого альфа-тромбина, связанного с гемадином — прочно связывающимся ингибитором тромбина из сухопутной пиявки Haemadipsa sylvestris, — показав, что его N-конец блокирует активный центр тромбина подобно hirudin, но его кислый C-конец уникальным образом взаимодействует с гепарин-связывающим экзосайтом (exosite II), а не с экзосайтом распознавания фибриногена, который использует hirudin. Сообщается, что гемадин ингибирует как свободный, так и связанный с тромбомодулином тромбин, но не мейзотромбин, что, по замечанию авторов, делает его кандидатом в антитромботические средства и шаблоном для разработки новых агентов. Это важно для нарратива о поиске лекарств в секретоме пиявки, поскольку документирует второй антикоагулянт пиявки с отчётливым, чётко определённым молекулярным механизмом, иллюстрируя фармакологическое разнообразие ингибиторов тромбина, полученных из пиявок. Будучи структурным и биохимическим исследованием, оно характеризует режим связывания одной молекулы и само по себе не устанавливает клиническую эффективность или безопасность у пациентов.
Связанные соединения в реестре ASH
Цитирование
Crystal structure of the human alpha-thrombin-haemadin complex: an exosite II-binding inhibitor
Richardson JL et al. · The EMBO journal, 2000
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Похожие исследования
Другие рецензируемые исследования в разделе «Разработка лекарственных препаратов».
- Novel Leech Antimicrobial Peptides — Hirunipins — Kumar et al. (2025)
- Medicinal Leech Draft Genome — Anticoagulant Gene Survey — Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME (2020)
- Влияние гирудотерапии на функции печени, липидный профиль и чувствительность к инсулину у крыс с метаболическим синдромом — Bilden A et al. (2026)
- Гирудотерапия в медицине и стоматологии — Jha K et al. (2015)
- Лечение медицинскими пиявками (гирудотерапия): краткий обзор — Singh A (2010)
- Гирудотерапия при ранней пресбиакузии у ликвидаторов аварии на Чернобыльской АЭС в поставарийные годы — Zabolotnyi D, Mishchanchuk N (2019)
- Изучение оксидантно-антиоксидантного статуса у пациентов, получавших гирудотерапию: экспериментальное исследование — Sarikan I, Savas H (2024)
- Терапевтическое применение пиявок — Abdualkader A et al. (2013)
- Неокклюзионная мезентериальная ишемия, вызванная гирудотерапией: клинический случай — Akalın Ç, Ekmen N (2020)
- Лечение пиявками: история — Hyson J (2005)
Добавлено в библиотеку ASH: 27 мая 2026 г. · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.