Использование метабаркодинга для сравнения пригодности двух видов кровососущих пиявок для оценки разнообразия млекопитающих на Северном Борнео
Using metabarcoding to compare the suitability of two blood-feeding leech species for sampling mammalian diversity in North Borneo
Полевое сравнительное исследование в журнале Molecular ecology resources (2018)
Аннотация
The application of high-throughput sequencing (HTS) for metabarcoding of mixed samples offers new opportunities in conservation biology. Recently, the successful detection of prey DNA from the guts of leeches has raised the possibility that these, and other blood-feeding invertebrates, might serve as useful samplers of mammals. Yet little is known about whether sympatric leech species differ in their feeding preferences, and whether this has a bearing on their relative suitability for monitoring local mammalian diversity. To address these questions, we collected spatially matched samples of two congeneric leech species Haemadipsa picta and Haemadipsa sumatrana from lowland rainforest in Borneo. For each species, we pooled ~500 leeches into batches of 10 individuals, performed PCR to target a section of the mammalian 16S rRNA locus and undertook sequencing of amplicon libraries using an Illumina MiSeq. In total, we identified sequences from 14 mammalian genera, spanning nine families and five orders. We found greater numbers of detections, and higher diversity of OTUs, in H. picta compared with H. sumatrana, with rodents only present in the former leech species. However, comparison of samples from across the landscape revealed no significant difference in mammal community composition between the leech species. We therefore suggest that H. picta is the more suitable iDNA sampler in this degraded Bornean forest. We conclude that the choice of invertebrate sampler can influence the detectability of different mammal groups and that this should be accounted for when designing iDNA studies.
Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.
Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.
Резюме
Во влажном лесу низменностей Борнео собраны пространственно сопоставленные пробы двух видов пиявок — Haemadipsa picta и H. sumatrana (около 500 особей каждого вида, пулы по 10); проведён метабаркодинг участка 16S рРНК млекопитающих на Illumina MiSeq. Идентифицированы последовательности 14 родов, 9 семейств и 5 отрядов; у H. picta больше обнаружений и выше разнообразие OTU, грызуны встречены только у неё. Состав сообществ млекопитающих между видами значимо не различался; авторы предлагают считать H. picta более пригодным источником образцов iDNA в этом деградированном лесу.
Почему это важно для гирудотерапии
В этом полевом исследовании собирались пространственно сопоставленные образцы двух родственных наземных видов пиявок (Haemadipsa picta и H. sumatrana) из низменного тропического леса на Борнео, около 500 пиявок каждого вида объединялись в партии по 10, и с помощью метабаркодирования на платформе Illumina MiSeq сегмента 16S rRNA млекопитающих из их кровяных трапез выявлялись последовательности 14 родов млекопитающих (девять семейств, пять отрядов), при этом было обнаружено больше выявлений и более высокое разнообразие OTU (включая грызунов, присутствовавших только у H. picta), и сделан вывод, что H. picta является более подходящим сборщиком ДНК беспозвоночного происхождения (iDNA) в этом деградированном лесу. К гирудотерапии оно имеет отношение главным образом как окно в биологию пиявок и их поведение при питании на хозяине, а также как напоминание о том, что кровососущие пиявки заглатывают и удерживают материал хозяина, что концептуально важно для вопросов гемотрансмиссивных патогенов при клиническом применении пиявок. Оговорка: это методическое исследование по биоразнообразию и охране природы диких лесных пиявок, а не медицинского вида Hirudo medicinalis и не клиническое исследование; оно не имеет отношения к терапевтической эффективности или безопасности пациентов и носит исключительно контекстуальный характер.
Цитирование
Using metabarcoding to compare the suitability of two blood-feeding leech species for sampling mammalian diversity in North Borneo.
Drinkwater R et al. · Molecular ecology resources, 2018
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Похожие исследования
Другие рецензируемые исследования в разделе «Разработка лекарственных препаратов».
- Novel Leech Antimicrobial Peptides — Hirunipins — Kumar et al. (2025)
- Medicinal Leech Draft Genome — Anticoagulant Gene Survey — Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME (2020)
- Влияние гирудотерапии на функции печени, липидный профиль и чувствительность к инсулину у крыс с метаболическим синдромом — Bilden A et al. (2026)
- Гирудотерапия в медицине и стоматологии — Jha K et al. (2015)
- Лечение медицинскими пиявками (гирудотерапия): краткий обзор — Singh A (2010)
- Гирудотерапия при ранней пресбиакузии у ликвидаторов аварии на Чернобыльской АЭС в поставарийные годы — Zabolotnyi D, Mishchanchuk N (2019)
- Изучение оксидантно-антиоксидантного статуса у пациентов, получавших гирудотерапию: экспериментальное исследование — Sarikan I, Savas H (2024)
- Терапевтическое применение пиявок — Abdualkader A et al. (2013)
- Неокклюзионная мезентериальная ишемия, вызванная гирудотерапией: клинический случай — Akalın Ç, Ekmen N (2020)
- Лечение пиявками: история — Hyson J (2005)
Добавлено в библиотеку ASH: 28 мая 2026 г. · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.