Vollständiges cox 1-Gen und ITS-Sequenz von Hirudinaria manillensis und Analyse der molekularen Evolution

Hirudinaria manillensis is an important blood-sucking medicinal leech widely distributed in Southeast Asia and southern China. It has been shown to treat cardiovascular and cerebrovascular diseases. Molecular identification technology has developed rapidly, and the results are accurate and stable, which can help us to obtain rich biological information of samples for genetic evolution analysis. This study designed 3 pairs of primers for complete cox 1 gene. After sequencing by PCR products and splicing by SeqMan software, the full-length sequence of cox 1 gene was obtained by annotation of open reading frame (ORFs) on MITOS2 platform. The cox 1 gene with a length of 1536nt was obtained, and the species was identified as Hirudinaria manillensis. The Hd value and FST value of cox 1 gene were 0.858 and 0.10938, which were higher than the Hd value of ITS (0.314) and the FST value close to 0. The nucleotide diversity and GST values of the two genes were very low, and the Tajima's D values of the neutral test were negative, without statistical significance. The genetic distance calculated by the Kimura-2 parameter method was very low. According to the biological information provided by the samples in this study, the population size of Hirudinaria manillensis in southern China was on the rise, but stable genetic diversity was not formed, and there was no obvious population differentiation and geographical isolation. This may be due to the mature artificial breeding technology in recent years, which enabled Hirudinaria manillensis to migrate from the traditional gathering places and breed in a large number in the new environment and migration site. At present, there are many molecular barcoding data of cox 1 gene in the NCBI database, but there is no complete cox 1 gene sequence as a reference, and the related ITS sequence information is more limited, indicating that there is still a lot of space for gene research of Hirudinaria manillensis.

Abstract aus PubMed (NCBI) für den zitierten Eintrag, in der Originalsprache wiedergegeben. Maßgeblich ist die Fassung der Originalpublikation.

Das Abstract wird nicht übersetzt, damit die eigene Wortwahl der Autoren erhalten bleibt.

Mit drei Primerpaaren wurde das vollständige cox 1-Gen (1536 nt) von Hirudinaria manillensis amplifiziert und die Art bestätigt. Hd-Wert (0,858) und FST (0,10938) von cox 1 übertrafen die des ITS (Hd 0,314; FST nahe 0); Nukleotiddiversität und GST waren sehr niedrig, Tajima's D negativ ohne Signifikanz, die genetischen Distanzen (Kimura-2-Parameter) sehr gering. Demnach nimmt die Populationsgröße in Südchina zu, bildete aber keine stabile genetische Diversität aus; eine deutliche Populationsdifferenzierung oder geografische Isolation fehlt, möglicherweise bedingt durch die ausgereifte Zuchttechnik.

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