Elektrostatische Steuerung und ionische Verankerung bei der Bildung von Thrombin-Hirudin-Komplexen: die Rolle der anionenbindenden Exosite-I von Thrombin
Electrostatic steering and ionic tethering in the formation of thrombin-hirudin complexes: the role of the thrombin anion-binding exosite-I
In-vitro-Studie in der Zeitschrift Biochemistry (2001)
Abstract
Electrostatic interactions between the thrombin anion-binding exosite-I (ABE-I) and the hirudin C-terminal tail play an important role in the formation of the thrombin-hirudin inhibitor complex and serves as a model for the interactions of thrombin with its many other ligands. The role of each solvent exposed basic residue in ABE-I (Arg(35), Lys(36), Arg(67), Arg(73), Arg(75), Arg(77a), Lys(81), Lys(109), Lys(110), and Lys(149e)) in electrostatic steering and ionic tethering in the formation of thrombin-hirudin inhibitor complexes was explored by site directed mutagenesis. The contribution to the binding energy (deltaG(degrees)b) by each residue varied from 1.9 kJ mol(-)(1) (Lys(110)) to 15.3 kJ mol(-1) (Arg(73)) and were in general agreement to their observed interactions with hirudin residues in the thrombin-hirudin crystal structure [Rydel, T. J., Tulinsky, A., Bode, W., and Huber, R. (1991) J. Mol. Biol. 221, 583-601]. Coupling energies (delta deltaG(degrees) int) were calculated for the major ion-pair interactions involved in ionic tethering using complementary hirudin mutants (h-D55N, h-E57Q, and h-E58Q). Cooperativity was seen for the h-Asp(55)/Arg(73) ion pair (2.4 kJ mol(-1)); however, low coupling energies for h-Asp(55)/Lys(149e) (deltadeltaG(degrees)int 0.6 kJ mol(-1)) and h-Glu(58)/Arg(77a) (deltadeltaG(degrees)int 0.9 kJ mol(-1)) suggest these are not major interactions, as anticipated by the crystal structure. Interestingly, high coupling energies were seen for the intermolecular ion-pair h-Glu(57)/Arg(75) (deltadeltaG(degrees)int 2.3 kJ mol(-1)) and for the solvent bridge h-Glu(57)/Arg(77a) (deltadeltaG(degrees)int 2.7 kJ mol(-1)) indicating that h-Glu(57) interacts directly with both Arg(75) and Arg(77a) in the thrombin-hirudin inhibitor complex. The remaining ABE-I residues that do not form major contacts in tethering the C-terminal tail of hirudin make small but collectively important contributions to the overall positive electrostatic field generated by ABE-I important in electrostatic steering.
Abstract aus PubMed (NCBI) für den zitierten Eintrag, in der Originalsprache wiedergegeben. Maßgeblich ist die Fassung der Originalpublikation.
Das Abstract wird nicht übersetzt, damit die eigene Wortwahl der Autoren erhalten bleibt.
Zusammenfassung
Anhand gerichteter Mutagenese wurde der Beitrag jedes basischen Restes der anionenbindenden Exosite-I zur Bindungsenergie im Thrombin-Hirudin-Komplex bestimmt. Er variierte von 1,9 kJ/mol (Lys110) bis 15,3 kJ/mol (Arg73) und stimmte im Allgemeinen mit der Kristallstruktur überein. Mit komplementären Hirudin-Mutanten zeigte sich Kooperativität bei h-Asp55/Arg73 (2,4 kJ/mol), hohe Kopplungsenergien bei h-Glu57/Arg75 und h-Glu57/Arg77a (2,3 bzw. 2,7 kJ/mol), niedrige bei h-Asp55/Lys149e (0,6 kJ/mol). Die übrigen Reste tragen nach Ansicht der Autoren gemeinsam zum elektrostatischen Feld bei, das die Anziehung lenkt.
Warum dies für die Hirudotherapie relevant ist
Diese Studie nutzte ortsspezifische Mutagenese, um zu untersuchen, wie einzelne basische Reste innerhalb der Anionen-bindenden Exosite-I von Thrombin zur elektrostatischen Steuerung und zum ionischen Tethering im Thrombin-Hirudin-Inhibitorkomplex beitragen, und quantifizierte Beiträge zur Bindungsenergie sowie Kopplungsenergien für wichtige Ionenpaar-Wechselwirkungen. Hirudin ist der potente direkte Thrombininhibitor, der natürlicherweise von medizinischen Blutegeln sezerniert wird, wodurch diese detaillierte Struktur-Energetik-Analyse direkt relevant für das Verständnis des prototypischen Antikoagulans des Blutegelsekretoms ist und die Rationale für klinisch eingesetzte Hirudin-basierte therapeutische Analoge informiert. Die Ergebnisse verdeutlichen, welche Thrombin-Hirudin-Kontakte energetisch am bedeutsamsten sind, und liefern mechanistische Einblicke, die die Weiterentwicklung von aus Blutegeln stammenden Antikoagulationsstrategien leiten könnten. Allerdings handelt es sich um eine biochemische Untersuchung molekularer Bindungswechselwirkungen; sie befasst sich nicht mit klinischen Ergebnissen, therapeutischer Dosierung oder Wirksamkeit der Hirudotherapie in vivo.
Verwandte Verbindungen im ASH-Register
Aus dem Blutegel stammende Moleküle und aus Hirudin abgeleitete Arzneimittel, die zum Thema dieser Arbeit gehören, jeweils mit vollständigem Profil im ASH-Verbindungsregister:
Zitation
Literaturangabe (Vancouver-Stil)
Myles T, Le Bonniec BF, Betz A, Stone SR. Electrostatic steering and ionic tethering in the formation of thrombin-hirudin complexes: the role of the thrombin anion-binding exosite-I. Biochemistry. 2001;40(16):4972-4979. doi:10.1021/bi0023549. PMID: 11305913
Die bibliografischen Angaben (Autoren, Band, Seiten, DOI) stammen aus dem PubMed-Eintrag.
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