Strukturmodell eines Antistasin/Notch-ähnlichen Fusionsproteins aus der Kokonwand des aquatischen Blutegels Theromyzon tessulatum

The aquatic leech, Theromyzon tessulatum, secretes a proteinaceous cocoon with extraordinary physical properties (e.g., proteolytic, thermal resiliency). The deduced amino acid sequence of a major protein (Tcp-Theromyzon cocoon protein) from the T. tessulatum cocoon wall has been used to model the endogenous structure of the Tcp protein. The Tcp protein sequence comprises six internal repeats, each containing 12 ordered Cys residues. Amino acid alignments suggest that the region Cys1-->6 is homologous to antistasin, a leech anticoagulant, and Cys7-->12 is homologous to an epidermal growth factor-like domain found in notch-class proteins, which play critical roles in development, signaling, and adhesion throughout the Animalia. Modeling of individual domains (i.e., antistasin and notch) positions multiple hydrophobic and charged residues on the surface. When the antistasin and notch domains were fused, hydrophobic pockets appeared that may facilitate a polymerization mechanism. Collectively, the predicted features of our Tcp model are consistent with the physical properties of the leech cocoon wall.

Abstract aus PubMed (NCBI) für den zitierten Eintrag, in der Originalsprache wiedergegeben. Maßgeblich ist die Fassung der Originalpublikation.

Das Abstract wird nicht übersetzt, damit die eigene Wortwahl der Autoren erhalten bleibt.

Aus der abgeleiteten Aminosäuresequenz eines Hauptproteins (Tcp) der Kokonwand von Theromyzon tessulatum wurde dessen Struktur modelliert. Tcp umfasst sechs interne Wiederholungen mit je 12 geordneten Cysteinresten; Sequenzvergleiche legen nahe, dass Cys1→6 dem Antistasin, einem Antikoagulans des Blutegels, und Cys7→12 einer EGF-ähnlichen Domäne der Notch-Klasse homolog ist. Die Modellierung positioniert hydrophobe und geladene Reste an der Oberfläche; fusionierte Domänen bilden hydrophobe Taschen, die eine Polymerisierung erleichtern könnten. Die vorhergesagten Eigenschaften stimmen mit den physikalischen Eigenschaften der Kokonwand überein.

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