Entwurf der Genomsequenzen von Hirudo medicinalis und Speicheltranskriptom von drei eng verwandten medizinischen Blutegeln
Draft genome sequences of Hirudo medicinalis and salivary transcriptome of three closely related medicinal leeches
Genom- und Transkriptomstudie in der Zeitschrift BMC Genomics (2020)
Abstract
BACKGROUND: Salivary cell secretion (SCS) plays a critical role in blood feeding by medicinal leeches, making them of use for certain medical purposes even today. RESULTS: We annotated the Hirudo medicinalis genome and performed RNA-seq on salivary cells isolated from three closely related leech species, H. medicinalis, Hirudo orientalis, and Hirudo verbana. Differential expression analysis verified by proteomics identified salivary cell-specific gene expression, many of which encode previously unknown salivary components. However, the genes encoding known anticoagulants have been found to be expressed not only in salivary cells. The function-related analysis of the unique salivary cell genes enabled an update of the concept of interactions between salivary proteins and components of haemostasis. CONCLUSIONS: Here we report a genome draft of Hirudo medicinalis and describe identification of novel salivary proteins and new homologs of genes encoding known anticoagulants in transcriptomes of three medicinal leech species. Our data provide new insights in genetics of blood-feeding lifestyle in leeches.
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Das Abstract wird nicht übersetzt, damit die eigene Wortwahl der Autoren erhalten bleibt.
Zusammenfassung
Das Genom von Hirudo medicinalis wurde annotiert und RNA-Seq an Speicheldrüsenzellen von H. medicinalis, H. orientalis und H. verbana durchgeführt. Durch differentielle Expressionsanalyse mit proteomischer Verifizierung wurden speicheldrüsenspezifische Gene identifiziert, viele davon kodieren zuvor unbekannte Speichelkomponenten. Gene bekannter Antikoagulanzien waren indes nicht nur in Speicheldrüsenzellen exprimiert. Die Autoren aktualisieren das Konzept der Interaktionen zwischen Speichelproteinen und Hämostase-Komponenten und beschreiben neue Speichelproteine sowie neue Homologe von Genen bekannter Antikoagulanzien, was neue Einsichten in die Genetik der blutsaugenden Lebensweise eröffnet.
Warum dies für die Hirudotherapie relevant ist
Diese Studie berichtet über eine vorläufige Genom-Annotation von Hirudo medicinalis sowie eine RNA-seq-Analyse von Speicheldrüsenzellen dreier nahe verwandter medizinischer Blutegelarten (H. medicinalis, H. orientalis und H. verbana), die mittels Proteomik verifiziert wurde. Die Untersuchenden identifizierten zahlreiche speicheldrüsenzellspezifische Gene, die für zuvor unbekannte Speichelkomponenten kodieren, entdeckten neue Homologe bekannter Antikoagulanzien-kodierender Gene und stellten fest, dass Gene für bekannte Antikoagulanzien nicht nur in Speicheldrüsenzellen exprimiert werden. Diese genomische und transkriptomische Ressource beschreibt die genetische Grundlage des Blutsaugens und die Vielfalt bioaktiver Verbindungen in medizinischen Blutegeln, die für die Hirudotherapie von zentraler Bedeutung sind. Einschränkung: Hierbei handelt es sich um eine Genom- und Transkriptom-Charakterisierungsstudie; sie bewertet weder die therapeutische Wirksamkeit, klinische Ergebnisse noch eine funktionelle Validierung der neu identifizierten Speichelkomponenten.
Zitation
Literaturangabe (Vancouver-Stil)
Babenko VV, Podgorny OV, Manuvera VA, Kasianov AS, Manolov AI, Grafskaia EN, et al. Draft genome sequences of Hirudo medicinalis and salivary transcriptome of three closely related medicinal leeches. BMC Genomics. 2020;21(1):331. doi:10.1186/s12864-020-6748-0. PMID: 32349672
Die bibliografischen Angaben (Autoren, Band, Seiten, DOI) stammen aus dem PubMed-Eintrag.
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