Das Genom des medizinischen Blutegels kodiert für 21 Innexin-Gene: identifizierte zentrale Neurone exprimieren verschiedene Kombinationen
The medicinal leech genome encodes 21 innexin genes: different combinations are expressed by identified central neurons
Genomstudie in der Zeitschrift Dev Genes Evol (2012)
Abstract
Gap junctional proteins are important components of signaling pathways required for the development and ongoing functions of all animal tissues, particularly the nervous system, where they function in the intracellular and extracellular exchange of small signaling factors and ions. In animals whose genomes have been sufficiently sequenced, large families of these proteins, connexins, pannexins, and innexins, have been found, with 25 innexins in the nematode Caenorhabditis elegans Starich et al. (Cell Commun Adhes 8: 311-314, 2001) and at least 37 connexins in the zebrafish Danio rerio Cruciani and Mikalsen (Biol Chem 388:253-264, 2009). Having recently sequenced the medicinal leech Hirudo verbana genome, we now report the presence of 21 innexin genes in this species, nine more than we had previously reported from the analysis of an EST-derived transcriptomic database Dykes and Macagno (Dev Genes Evol 216: 185-97, 2006); Macagno et al. (BMC Genomics 25:407, 2010). Gene structure analyses show that, depending on the leech innexin gene, they can contain from 0 to 6 introns, with closely related paralogs showing the same number of introns. Phylogenetic trees comparing Hirudo to another distantly related leech species, Helobdella robusta, shows a high degree of orthology, whereas comparison to other annelids shows a relatively low level. Comparisons with other Lophotrochozoans, Ecdyzozoans and with vertebrate pannexins suggest a low number (one to two) of ancestral innexin/pannexins at the protostome/deuterostome split. Whole-mount in situ hybridization for individual genes in early embryos shows that ∼50% of the expressed innexins are detectable in multiple tissues. Expression analyses using quantitative PCR show that ∼70% of the Hirudo innexins are expressed in the nervous system, with most of these detected in early development. Finally, quantitative PCR analysis of several identified adult neurons detects the presence of different combinations of innexin genes, a property that may underlie the participation of these neurons in different adult coupling circuits.
Abstract aus PubMed (NCBI) für den zitierten Eintrag, in der Originalsprache wiedergegeben. Maßgeblich ist die Fassung der Originalpublikation.
Das Abstract wird nicht übersetzt, damit die eigene Wortwahl der Autoren erhalten bleibt.
Zusammenfassung
Im Genom des medizinischen Blutegels Hirudo verbana fanden sich 21 Innexin-Gene, neun mehr als zuvor aus EST-Daten beschrieben; sie enthalten 0 bis 6 Introns, nahe verwandte Paraloge zeigen dieselbe Intronzahl. Phylogenetisch besteht hohe Orthologie zu Helobdella robusta, geringe zu anderen Anneliden. Etwa 50 % der exprimierten Innexine waren in frühen Embryonen in mehreren Geweben nachweisbar; rund 70 % der Innexine werden im Nervensystem exprimiert. Identifizierte adulte Neurone exprimieren unterschiedliche Innexin-Kombinationen, was ihre Beteiligung an verschiedenen Kopplungskreisen erklären könnte.
Kontext
Diese Studie berichtet über das Vorkommen von 21 Innexin-Genen im Genom des medizinischen Blutegels Hirudo verbana und charakterisiert deren Genstrukturen, phylogenetische Verwandtschaftsbeziehungen sowie Expressionsmuster im Verlauf der Entwicklung und in identifizierten adulten Neuronen. Etwa 70 % der Innexine werden im Nervensystem exprimiert, wobei in einzelnen identifizierten Neuronen unterschiedliche Kombinationen nachweisbar sind – eine Eigenschaft, die ihrer Beteiligung an verschiedenen Kopplungsschaltkreisen zugrunde liegen könnte. Die Arbeit stellt genomische und neurowissenschaftliche Forschung an Hirudo verbana dar; der Abstract enthält keine therapeutischen oder sekretombezogenen Aussagen.
Zitation
Literaturangabe (Vancouver-Stil)
Kandarian B, Sethi J, Wu A, Baker M, Yazdani N, Kym E, et al. The medicinal leech genome encodes 21 innexin genes: different combinations are expressed by identified central neurons. Dev Genes Evol. 2012;222(1):29-44. doi:10.1007/s00427-011-0387-z. PMID: 22358128
Die bibliografischen Angaben (Autoren, Band, Seiten, DOI) stammen aus dem PubMed-Eintrag.
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