Chromosome-level genome assembly of the cave leech Sinospelaeobdella cavatuses (Hirudinea: Haemadipsidae)
Research article published in Scientific data (2024)
Abstract
Leeches are famous for their high medical value and wide environmental adaptability. Among them, cave leeches are a very fascinating and rare group, which is an important component in the study of adaptive evolution of leeches. However, no study has yet reported a reference genome for this group. In this study, we assembled a high-quality chromosome-level genome of the cave terrestrial leech Sinospelaeobdella cavatuses, through Illumina and PacBio sequencing, alongside chromosome conformation capture techniques. The resulting genome spans 153.67 Mb across 9 pseudochromosomes(range: 11.33 to 23.53 Mb), with a mounting rate of up to 95.37% and features an N50 length of 17.15 Mb. This genome is composed of 35.16% repetitive elements and contains 21180 predicted protein-coding genes. Decoding the S. cavatuses genome not only promotes future studies on study of its phylogeny, evolution, and behavior, but also provides valuable resources for in-depth investigation on adaptive evolution of leech.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Zusammenfassung
Leeches are famous for their high medical value and wide environmental adaptability.
Warum dies für die Hirudotherapie relevant ist
Diese Studie berichtet über das erste hochwertige Referenzgenom auf Chromosomenebene für den höhlenbewohnenden terrestrischen Blutegel Sinospelaeobdella cavatuses, assembliert mittels Illumina, PacBio und Chromosomenkonformationserfassung. Das Genom umfasst 153,67 Mb verteilt auf 9 Pseudochromosomen mit einer Montagerate von 95,37 %, einem N50 von 17,15 Mb, 35,16 % repetitiven Elementen und 21.180 vorhergesagten proteincodierenden Genen. Für ASH hält das Abstract fest, dass Blutegel 'berühmt für ihren hohen medizinischen Wert' sind, was eine allgemeine Grundlage für die Aufnahme bietet, obwohl dieser spezifische Höhlenblutegel nicht als therapeutisch verwendet beschrieben wird. Jedoch handelt es sich um einen Genomassemblierungsbericht – er enthält keine Analyse bioaktiver Verbindungen, Speichelantikoagulanzien, therapeutischer Daten oder Anwendungen der Hirudotherapie. Seine Relevanz für den Bereich der ASH ist ausschließlich indirekt.
Zitation
Chromosome-level genome assembly of the cave leech Sinospelaeobdella cavatuses (Hirudinea: Haemadipsidae)
Yao B et al. · Scientific data, 2024
Verwandter klinischer Kontext
Erfahren Sie, wie diese Forschung mit der klinischen Praxis verknüpft ist
Zur ASH-Bibliothek hinzugefügt: May 27, 2026 · Letzte Aktualisierung der Website: 18. Juni 2026