NMR-based structural characterization of a two-disulfide-bonded analogue of the FXIIIa inhibitor tridegin
Structural biology published in International Journal of Molecular Sciences (2021)
Abstract
The saliva of blood-sucking leeches contains a plethora of anticoagulant substances. One of these compounds derived from Haementeria ghilianii, the 66mer three-disulfide-bonded peptide tridegin, specifically inhibits the blood coagulation factor FXIIIa. Tridegin represents a potential tool for antithrombotic and thrombolytic therapy. We recently synthesized two-disulfide-bonded tridegin variants, which retained their inhibitory potential. For further lead optimization, however, structure information is required. We thus analyzed the structure of a two-disulfide-bonded tridegin isomer by solution 2D NMR spectroscopy in a combinatory approach with subsequent MD simulations. The isomer was studied using two fragments, i.e., the disulfide-bonded N-terminal (Lys1-Cys37) and the flexible C-terminal part (Arg38-Glu66), which allowed for a simplified, label-free NMR-structure elucidation of the 66mer peptide. The structural information was subsequently used in molecular modeling and docking studies to provide insights into the structure-activity relationships. The present study will prospectively support the development of anticoagulant-therapy-relevant compounds targeting FXIIIa.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Резюме
NMR structural characterization of two-disulfide tridegin variants reveals key folds for FXIIIa inhibition — insights for next-generation leech-derived inhibitor design.
Почему это важно для гирудотерапии
В данном исследовании сообщается о структуре тридегина в растворе, определённой методом ЯМР, для аналога с двумя дисульфидными связями — 66-членного пептида из пиявки Haementeria ghilianii, специфически ингибирующего фактор свёртывания крови FXIIIa, с применением двухфрагментного подхода в сочетании с моделированием методом молекулярной динамики. Работа имеет значение для гирудотерапии и секретома пиявок, поскольку продвигает оптимизацию лида — пиявочного антитромботического/тромболитического кандидата — в направлении потенциального терапевтического применения, нацеленного на FXIIIa. Структурные данные поддерживают исследования молекулярного моделирования и докинга, направленные на понимание взаимосвязей структура–активность. Честная оговорка состоит в том, что это доклиническое биофизическое исследование; оно не включает животных или людей, не предполагает применения пиявкотерапии, а терапевтическая релевантность носит перспективный характер — в аннотации не заявляется клиническая эффективность или одобрение FDA.
Цитирование
NMR-based structural characterization of a two-disulfide-bonded analogue of the FXIIIa inhibitor tridegin.
Schmitz T et al. · International journal of molecular sciences, 2021
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Добавлено в библиотеку ASH: May 27, 2026 · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.