Кинетический путь перехода тромбина из медленной формы в быструю. Свидетельства сопряжённого связывания лигандов в структурно различных доменах

The kinetic pathway for the Na+-induced slow --> fast transition of thrombin was characterized. The slow form was shown to consist of two conformers in a 3:1 ratio (ES2:ES1) at 5 degrees C, pH 7.4, Gamma/2 0.3. ES2 binds Na+ 3 orders of magnitude faster than does ES1. The small molecule active site-directed inhibitor L-371,912, and the exosite I binding ligand hirugen, like Na+, bind selectively to ES2 and induce the slow --> fast conversion of thrombin. The slow --> fast transition is limited by the rate of conversion of ES1 to ES2 (k approximately 28 s-1 at 5 degrees C). Replacement of Arg-221a or Lys-224 at the Na+ binding site with Ala appears to selectively alter the slow form and reduce the apparent affinity of the mutants for Na+ and L-371,912. This replacement, however, has little effect on the affinity for the inhibitor in the presence of saturating concentrations of Na+. The kinetically linked ligand binding at the Na+ binding site, exosite I, and the active site of thrombin characterized in the present study indicates the basis for the plasticity of this important enzyme, and suggests the possibility that the substrate specificity and, therefore, the procoagulant and anticoagulant activities of thrombin may be subject to allosteric regulation by as yet unidentified physiologically important effectors.

Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.

Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.

Охарактеризован кинетический путь Na+-индуцированного перехода тромбина из медленной формы в быструю. При 5 °C и pH 7,4 медленная форма включает два конформера в соотношении 3:1, различающихся скоростью связывания Na+ на три порядка; ингибитор L-371,912 и лиганд экзосайта I гируген избирательно связываются с одним из них и индуцируют переход, лимитируемый скоростью превращения конформеров (около 28 с⁻¹). Сопряжённое связывание лигандов в натриевом сайте, экзосайте I и активном центре указывает на пластичность тромбина и возможную аллостерическую регуляцию его активностей неидентифицированными физиологическими эффекторами.

Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой

Другие рецензируемые исследования в разделе «Разработка лекарственных препаратов».

• Гирудотерапия в медицине и стоматологии — Jha K et al. (2015)
• Лечение пиявками: история — Hyson J (2005)
• Гирудины азиатской медицинской пиявки Hirudinaria manillensis: те же, но другие — Lukas P et al. (2019)
• Транскриптомный анализ слюнной железы медицинской пиявки Hirudo nipponia — Lu Z et al. (2018)
• Молекулярно-динамические и фармакологические исследования вариантов гирудина Hirudinaria manillensis и Hirudo medicinalis, созданных методами белковой инженерии — Sun Y et al. (2022)
• Бесклеточный синтез варианта 1 гирудина кровососущей пиявки Hirudo medicinalis — Wüstenhagen D et al. (2020)
• Получение вариантов гирудина с помощью генно-инженерной микробной фабрики — Zhang J, Lan N (2018)
• Гирудин при гепарин-индуцированной тромбоцитопении — Lubenow N, Greinacher A (2002)
• Гирудин ослабляет диабетическую нефропатию путём ингибирования Gsdmd-опосредованного пироптоза — Han J et al. (2023)
• Гирудин как альтернативный антикоагулянт: исторический обзор — Markwardt F (2002)

Все исследования, проанализированные ASH →