The molecular basis of thrombin allostery revealed by a 1.8 A structure of the "slow" form.
Research article published in Structure (London, England : 1993) (2003)
Abstract
Thrombin participates in its own positive and negative feedback loops, and its allosteric state helps determine the hemostatic balance. Here we present the 1.8 A crystallographic structure of S195A thrombin in two conformational states: active site occupied and active site free. The active site-occupied form shows how thrombin can accommodate substrates, such as protein C. The active site-free form is in a previously unobserved closed conformation of thrombin, which satisfies all the conditions of the so-called "slow" form. A mechanism of allostery is revealed, which relies on the concerted movement of the disulphide bond between Cys168 and 182 and aromatic residues Phe227, Trp215, and Trp60d. These residues constitute an allosteric switch, which is flipped directly through sodium binding, resulting in the fast form with an open active site.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Резюме
Thrombin participates in its own positive and negative feedback loops, and its allosteric state helps determine the hemostatic balance. Here we present the 1.8 A crystallographic structure of S195A thrombin in two conformational states: active site occupied and active site free.
Почему это важно для гирудотерапии
В данном исследовании представлена кристаллическая структура мутанта тромбина S195A с разрешением 1,8 Å в двух конформационных состояниях — с занятым активным центром и со свободным активным центром, — выявившая ранее не наблюдавшуюся закрытую конформацию, удовлетворяющую условиям «медленной» формы. Авторы выявили аллостерический переключатель, включающий дисульфидную связь Cys168–Cys182 и ароматические остатки Phe227, Trp215 и Trp60d, который переключается непосредственно при связывании натрия, приводя к «быстрой» форме с открытым активным центром. Работа расширяет понимание аллостерической регуляции тромбина, имеющее значение для биологии свёртывания крови в целом. ПРЕДУПРЕЖДЕНИЕ: В реферате нигде не упоминаются гирудин, соединения пиявочного происхождения или гирудотерапия; связь с областью интересов ASH носит исключительно косвенный характер — через структурную биологию тромбина, — и обоснованной связи с пиявками не существует.
Цитирование
The molecular basis of thrombin allostery revealed by a 1.8 A structure of the "slow" form.
Huntington et al. · Structure (London, England : 1993), 2003
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Добавлено в библиотеку ASH: May 28, 2026 · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.