Chromosome-level genome assembly of the cave leech Sinospelaeobdella cavatuses (Hirudinea: Haemadipsidae)
Research article published in Scientific data (2024)
Abstract
Leeches are famous for their high medical value and wide environmental adaptability. Among them, cave leeches are a very fascinating and rare group, which is an important component in the study of adaptive evolution of leeches. However, no study has yet reported a reference genome for this group. In this study, we assembled a high-quality chromosome-level genome of the cave terrestrial leech Sinospelaeobdella cavatuses, through Illumina and PacBio sequencing, alongside chromosome conformation capture techniques. The resulting genome spans 153.67 Mb across 9 pseudochromosomes(range: 11.33 to 23.53 Mb), with a mounting rate of up to 95.37% and features an N50 length of 17.15 Mb. This genome is composed of 35.16% repetitive elements and contains 21180 predicted protein-coding genes. Decoding the S. cavatuses genome not only promotes future studies on study of its phylogeny, evolution, and behavior, but also provides valuable resources for in-depth investigation on adaptive evolution of leech.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Resumen
Leeches are famous for their high medical value and wide environmental adaptability.
Por qué esto importa para la hirudoterapia
Este estudio presenta el primer genoma de referencia de alta calidad a nivel cromosómico para la sanguijuela terrestre cavernícola Sinospelaeobdella cavatuses, ensamblado mediante Illumina, PacBio y captura de conformación cromosómica. El genoma abarca 153,67 Mb distribuidos en 9 pseudocromosomas con una tasa de montaje del 95,37 %, un N50 de 17,15 Mb, un 35,16 % de elementos repetitivos y 21.180 genes codificadores de proteínas predichos. Para la ASH, el resumen señala que las sanguijuelas son 'famosas por su alto valor médico', proporcionando una base general para su inclusión, aunque esta sanguijuela cavernícola específica no se describe como utilizada en terapia. Sin embargo, se trata de un informe de ensamblaje genómico —no presenta análisis de compuestos bioactivos, anticoagulantes salivales, datos terapéuticos ni aplicaciones de hirudoterapia. Su relevancia con el ámbito de la ASH es completamente indirecta.
Citación
Chromosome-level genome assembly of the cave leech Sinospelaeobdella cavatuses (Hirudinea: Haemadipsidae)
Yao B et al. · Scientific data, 2024
Contexto clínico relacionado
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Añadido a la biblioteca ASH: May 27, 2026 · Última actualización del sitio: 18 de junio de 2026