Cambios en las interacciones en complejos de derivados de la hirudina y α-trombina humana debidos a diferentes formas cristalinas

The three-dimensional structures of D-Phe-Pro-Arg-chloromethyl ketone-inhibited thrombin in complex with Tyr-63-sulfated hirudin (ternary complex) and of thrombin in complex with the bifunctional inhibitor D-Phe-Pro-Arg-Pro-(Gly)4-hirudin (CGP 50,856, binary complex) have been determined by X-ray crystallography in crystal forms different from those described by Skrzypczak-Jankun et al. (Skrzypczak-Jankun, E., Carperos, V.E., Ravichandran, K.G., & Tulinsky, A., 1991, J. Mol. Biol. 221, 1379-1393). In both complexes, the interactions of the C-terminal hirudin segments of the inhibitors binding to the fibrinogen-binding exosite of thrombin are clearly established, including residues 60-64, which are disordered in the earlier crystal form. The interactions of the sulfate group of Tyr-63 in the ternary complex structure explain why natural sulfated hirudin binds with a 10-fold lower K(i) than the desulfated recombinant material. In this new crystal form, the autolysis loop of thrombin (residues 146-150), which is disordered in the earlier crystal form, is ordered due to crystal contacts. Interactions between the C-terminal fragment of hirudin and thrombin are not influenced by crystal contacts in this new crystal form, in contrast to the earlier form. In the bifunctional inhibitor-thrombin complex, the peptide bond between Arg-Pro (P1-P1') seems to be cleaved.

Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.

El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.

Se determinaron en nuevas formas cristalinas los complejos ternario de trombina con D-Phe-Pro-Arg-clorometilcetona e hirudina sulfatada en Tyr-63, y binario con el inhibidor bifuncional D-Phe-Pro-Arg-Pro-(Gly)4-hirudina (CGP 50,856). Las interacciones de los segmentos C-terminales con el exositio de unión al fibrinógeno, incluidos los residuos 60–64 antes desordenados, quedan claramente establecidas. El sulfato de Tyr-63 explica que la hirudina natural tenga una Ki 10 veces menor que el material recombinante desulfatado. En el complejo bifuncional, el enlace Arg-Pro (P1-P1') parece estar escindido.

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