Superación de la inhibición de la RT-qPCR asociada a heparina y de los problemas de normalización para la cuantificación de microARN en pacientes con infarto agudo de miocardio

BACKGROUND:  Cardiac-enriched micro ribonucleic acids (miRNAs) are released into the circulation following ST-elevation myocardial infarction (STEMI). Lack of standardized approaches for reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) data normalization and presence of RT-qPCR inhibitors (e.g. heparin) in patient blood samples have prevented reproducible miRNA quantification in this cohort and subsequent translation of these biomarkers to clinical practice. MATERIALS AND METHODS:  Using a RT-qPCR miRNA screening platform, we identified and validated an endogenous circulating miRNA as a normalization control. In addition, we assessed the effects of in vivo and in vitro anticoagulant drugs administration (heparin and bivalirudin) on three RT-qPCR normalization strategies (global miRNA mean, exogenous spike-in control [cel-miR-39] and endogenous miRNA control). Finally, we evaluated the effect of heparin and its in vitro inhibition with heparinase on the quantification of cardiac-enriched miRNAs in STEMI patients. RESULTS:  miR-425-5p was validated as an endogenous miRNA control. Heparin administration in vitro and in vivo inhibited all RT-qPCR normalization strategies. In contrast, bivalirudin had no effects on cel-miR-39 or miR-425-5p quantification. In vitro RNA sample treatment with 0.3 U of heparinase overcame heparin-induced over-estimation of cardiac-enriched miRNA levels and improved their correlation with high-sensitivity troponin T. CONCLUSION:  miRNA quantification in STEMI patients receiving heparin is jeopardized by its effect on all RT-qPCR normalization approaches. Use of samples from bivalirudin-treated patients or in vitro treatment of heparin-contaminated samples with heparinase are suitable alternatives for miRNA quantification in this cohort. Finally, we reinforce the evidence that cardiac-enriched miRNAs early after myocardial reperfusion reflect the severity of cardiac injury.

Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.

El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.

Se validó miR-425-5p como control endógeno para la cuantificación de microARN por RT-qPCR en el IAMCEST. La heparina inhibió in vitro e in vivo todas las estrategias de normalización; la bivalirudina no afectó a cel-miR-39 ni a miR-425-5p. Tratar las muestras con 0,3 U de heparinasa evitó la sobreestimación de los microARN cardiacos y mejoró su correlación con la troponina T de alta sensibilidad. Según los autores, usar muestras de pacientes tratados con bivalirudina o aplicar heparinasa son alternativas adecuadas.

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