Modelo estructural de una proteína de fusión de tipo antistasina/notch de la pared del capullo de la sanguijuela acuática Theromyzon tessulatum
Structural model of an antistasin/notch-like fusion protein from the cocoon wall of the aquatic leech, Theromyzon tessulatum
Estudio in silico en la revista J Mol Model (2006)
Resumen
The aquatic leech, Theromyzon tessulatum, secretes a proteinaceous cocoon with extraordinary physical properties (e.g., proteolytic, thermal resiliency). The deduced amino acid sequence of a major protein (Tcp-Theromyzon cocoon protein) from the T. tessulatum cocoon wall has been used to model the endogenous structure of the Tcp protein. The Tcp protein sequence comprises six internal repeats, each containing 12 ordered Cys residues. Amino acid alignments suggest that the region Cys1-->6 is homologous to antistasin, a leech anticoagulant, and Cys7-->12 is homologous to an epidermal growth factor-like domain found in notch-class proteins, which play critical roles in development, signaling, and adhesion throughout the Animalia. Modeling of individual domains (i.e., antistasin and notch) positions multiple hydrophobic and charged residues on the surface. When the antistasin and notch domains were fused, hydrophobic pockets appeared that may facilitate a polymerization mechanism. Collectively, the predicted features of our Tcp model are consistent with the physical properties of the leech cocoon wall.
Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.
El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.
Síntesis
Se modeló la estructura de una proteína principal (Tcp) del capullo de la sanguijuela Theromyzon tessulatum a partir de su secuencia deducida de aminoácidos. Tcp presenta seis repeticiones internas, cada una con 12 cisteínas ordenadas; según los alineamientos, Cys1→6 sería homóloga a la antistasina, anticoagulante de sanguijuela, y Cys7→12 a un dominio tipo factor de crecimiento epidérmico de la familia notch. Los dominios fusionados formarían cavidades hidrófobas que podrían facilitar la polimerización, acorde con las propiedades físicas del capullo.
Por qué esto importa para la hirudoterapia
Este estudio presenta un modelo molecular de Tcp (proteína del capullo de Theromyzon, del inglés Theromyzon cocoon protein), una importante proteína estructural de la pared del capullo de la sanguijuela acuática Theromyzon tessulatum, basado en el análisis deducido de la secuencia de aminoácidos. La secuencia de Tcp contiene seis repeticiones internas con 12 residuos de cisteína ordenados cada una; la región Cys1→6 muestra homología con la antistasina (un anticoagulante de sanguijuela) y la Cys7→12 con un dominio tipo notch tipo EGF, y el modelado sugiere cavidades hidrofóbicas que podrían facilitar la polimerización. Concierne a la biología estructural de proteínas de sanguijuela con homología de dominio anticoagulante de tipo antistasina. Advertencia: Se trata de un estudio computacional/de modelado de una proteína estructural del capullo de una especie de sanguijuela no medicinal; no se demuestra actividad anticoagulante o terapéutica funcional de la propia Tcp.
Compuestos relacionados del registro de la ASH
Moléculas de la sanguijuela y fármacos derivados de la hirudina relacionados con el tema de este artículo, cada uno con un perfil completo en el registro de compuestos de la ASH:
Citación
Referencia (estilo Vancouver)
Mason TA, McIlroy PJ, Shain DH. Structural model of an antistasin/notch-like fusion protein from the cocoon wall of the aquatic leech, Theromyzon tessulatum. J Mol Model. 2006;12(6):829-834. doi:10.1007/s00894-006-0107-1. PMID: 16523290
Los datos bibliográficos (autores, volumen, páginas, DOI) proceden del registro de PubMed.
Contexto clínico relacionado
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