Determinación de los enlaces disulfuro en péptidos antimicrobianos de la familia macina mediante la combinación de proteómica top-down y bottom-up
Determination of disulfide linkages in antimicrobial peptides of the macin family by combination of top-down and bottom-up proteomics
Estudio proteómico en la revista Journal of Proteomics (2014)
Resumen
UNLABELLED: Macins are a distinct class of antimicrobial peptides (AMPs) produced by leeches and Hydra. Their function depends strongly on their three-dimensional structure. In order to support structural elucidation of these AMPs, the knowledge and proper assignment of disulfide bonds formed in these cysteine-rich peptides is a prerequisite. In this report, we outline an analytical strategy, encompassing a combination of top-down MS based analytics and sequence-dependent enzyme cleavage under native conditions followed by high mass accuracy and high resolution MS/MS analysis by LTQ-Orbitrap MS to assign disulfide linkages of three members of the macin family, namely neuromacin, theromacin, and hydramacin-1. The results revealed that the eight cysteine residues conserved in all three macins form the same four disulfide bonds, i.e. [C1:C6], [C2:C5], [C3:C7], and [C4:C8]. Theromacin, which possess two additional cysteine residues, forms a fifth disulfide bond. BIOLOGICAL SIGNIFICANCE: Beside the high biological significance which is based on the inherent dependence of biological activity on the structural features of antimicrobial peptides (which holds true for entirely every protein), the presented analytical strategy will be of wide interest, as it widens the available toolbox for the analysis of this important posttranslational modification.
Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.
El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.
Síntesis
Las macinas son una clase diferenciada de péptidos antimicrobianos de sanguijuelas e Hydra, cuya función depende de su estructura tridimensional. Los autores combinaron MS top-down, escisión enzimática nativa y MS/MS en LTQ-Orbitrap para asignar los enlaces disulfuro de tres macinas: neuromacina, teromacina e hidramacina-1. Las ocho cisteínas conservadas forman los mismos cuatro enlaces [C1:C6], [C2:C5], [C3:C7] y [C4:C8]; teromacina, con dos cisteínas adicionales, forma un quinto. Los autores indican que la estrategia amplía el instrumental para esta modificación postraduccional.
Por qué esto importa para la hirudoterapia
Este estudio aplicó análisis basados en espectrometría de masas top-down combinados con escisión enzimática dependiente de secuencia en condiciones nativas, seguido de análisis MS/MS de alta resolución y alta exactitud de masa, para determinar los arreglos de enlaces disulfuro en tres miembros de la familia macin de péptidos antimicrobianos: neuromacin, theromacin e hydramacin-1. Los tres péptidos comparten ocho residuos de cisteína conservados que forman enlaces disulfuro idénticos ([C1:C6], [C2:C5], [C3:C7], [C4:C8]), mientras que theromacin posee dos cisteínas adicionales que forman un quinto enlace disulfuro. Las macinas son péptidos antimicrobianos producidos por sanguijuelas e Hydra. Esta caracterización estructural es relevante para comprender las propiedades de los péptidos antimicrobianos derivados de sanguijuelas, aunque se trata de un estudio de química analítica sin datos de actividad antimicrobiana funcional, aplicaciones terapéuticas o relevancia clínica presentados, y la conexión con la hirudoterapia es indirecta.
Compuestos relacionados del registro de la ASH
Moléculas de la sanguijuela y fármacos derivados de la hirudina relacionados con el tema de este artículo, cada uno con un perfil completo en el registro de compuestos de la ASH:
Citación
Referencia (estilo Vancouver)
Hung CW, Jung S, Grötzinger J, Gelhaus C, Leippe M, Tholey A. Determination of disulfide linkages in antimicrobial peptides of the macin family by combination of top-down and bottom-up proteomics. J Proteomics. 2014;103:216-226. doi:10.1016/j.jprot.2014.04.001. PMID: 24747305
Los datos bibliográficos (autores, volumen, páginas, DOI) proceden del registro de PubMed.
Contexto clínico relacionado
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