Síntesis, estructura y relaciones estructura-actividad de inhibidores divalentes de la trombina que contienen un mimético de estado de transición de tipo alfa-cetoamida

A new class of divalent thrombin inhibitors is described that contains an alpha-keto-amide transition-state mimetic linking an active site binding group and a group that binds to the fibrinogen-binding exosite. The X-ray crystallographic structure of the most potent member of this new class, CVS995, shows many features in common with other divalent thrombin inhibitors and clearly defines the transition-state-like binding of the alpha-keto-amide group. The structure of the active site part of the inhibitor shows a network of water molecules connecting both the side-chain and backbone atoms of thrombin and the inhibitor. Direct peptide analogues of the new transition-state-containing divalent thrombin inhibitors were compared using in vitro assays of thrombin inhibition. There was no direct correlation between the binding constants of the peptides and their alpha-keto-amide counterparts. The most potent alpha-keto-amide inhibitor, CVS995, with a Ki = 1 pM, did not correspond to the most potent divalent peptide and contained a single amino acid deletion in the exosite binding region with respect to the equivalent region of the natural thrombin inhibitor hirudin. The interaction energies of the active site, transition state, and exosite binding regions of these new divalent thrombin inhibitors are not additive.

Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.

El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.

Se describe una nueva clase de inhibidores divalentes de la trombina, con un mimético alfa-cetoamida del estado de transición que une el sitio activo y el exosito de unión al fibrinógeno. La estructura de rayos X del miembro más potente, CVS995 (Ki = 1 pM), define la unión tipo estado de transición y muestra una red de agua. Las constantes de unión de péptidos y análogos alfa-cetoamida no se correlacionan directamente, y las energías de interacción no son aditivas.

Explore cómo esta investigación se conecta con la práctica clínica

Más estudios revisados por pares en la categoría «Desarrollo de fármacos».

• Hirudoterapia en medicina y odontología — Jha K et al. (2015)
• Terapia con sanguijuelas: una historia — Hyson J (2005)
• Hirudinas de la sanguijuela medicinal asiática Hirudinaria manillensis: iguales, pero diferentes — Lukas P et al. (2019)
• Transcriptomic analysis of the salivary gland of medicinal leech Hirudo nipponia — Lu Z et al. (2018)
• Molecular dynamic and pharmacological studies on protein-engineered hirudin variants of Hirudinaria manillensis and Hirudo medicinalis — Sun Y et al. (2022)
• Síntesis acelular de la variante 1 de hirudina de la sanguijuela hematófaga Hirudo medicinalis — Wüstenhagen D et al. (2020)
• Producción de variantes de hirudina mediante fábricas microbianas modificadas genéticamente — Zhang J, Lan N (2018)
• Hirudina en la trombocitopenia inducida por heparina — Lubenow N, Greinacher A (2002)
• La hirudina mejora la nefropatía diabética al inhibir la piroptosis mediada por Gsdmd — Han J et al. (2023)
• La hirudina como anticoagulante alternativo: una revisión histórica — Markwardt F (2002)

Ver toda la investigación analizada por la ASH →