La base molecular de la alostería de la trombina revelada por una estructura a 1,8 Å de la forma «lenta»
The molecular basis of thrombin allostery revealed by a 1.8 A structure of the "slow" form
Estudio cristalográfico por rayos X en la revista Structure (London, England : 1993) (2003)
Resumen
Thrombin participates in its own positive and negative feedback loops, and its allosteric state helps determine the hemostatic balance. Here we present the 1.8 A crystallographic structure of S195A thrombin in two conformational states: active site occupied and active site free. The active site-occupied form shows how thrombin can accommodate substrates, such as protein C. The active site-free form is in a previously unobserved closed conformation of thrombin, which satisfies all the conditions of the so-called "slow" form. A mechanism of allostery is revealed, which relies on the concerted movement of the disulphide bond between Cys168 and 182 and aromatic residues Phe227, Trp215, and Trp60d. These residues constitute an allosteric switch, which is flipped directly through sodium binding, resulting in the fast form with an open active site.
Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.
El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.
Síntesis
Se presenta la estructura a 1,8 Å de la trombina S195A con centro activo ocupado y libre. La forma ocupada muestra cómo puede acomodar sustratos como la proteína C; la libre adopta una conformación cerrada, no observada antes, que cumple los criterios de la forma «lenta». La alostería radica en el movimiento concertado del puente disulfuro Cys168-Cys182 y de Phe227, Trp215 y Trp60d, interruptor que la unión de sodio conmuta para dar la forma rápida, con centro activo abierto.
Contexto
Este estudio presentó una estructura cristalina a 1,8 Å del mutante S195A de la trombina en dos estados conformacionales —con el sitio activo ocupado y con el sitio activo libre— revelando una conformación cerrada no observada previamente que satisface las condiciones de la forma 'lenta'. Los autores identificaron un interruptor alostérico que involucra el enlace disulfuro Cys168-Cys182 y los residuos aromáticos Phe227, Trp215 y Trp60d, que se activa directamente mediante la unión de sodio, dando como resultado la forma rápida con un sitio activo abierto. El trabajo avanza en la comprensión de la regulación alostérica de la trombina, relevante para la biología de la coagulación en general. No se mencionan en ningún lugar del resumen la hirudina, compuestos derivados de sanguijuela ni la hirudoterapia.
Citación
Referencia (estilo Vancouver)
Huntington JA, Esmon CT. The molecular basis of thrombin allostery revealed by a 1.8 A structure of the "slow" form. Structure. 2003;11(4):469-479. doi:10.1016/s0969-2126(03)00049-2. PMID: 12679024
Los datos bibliográficos (autores, volumen, páginas, DOI) proceden del registro de PubMed.
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