Refined 1.2 Å crystal structure of the complex formed between subtilisin Carlsberg and the inhibitor eglin c
Structural biology article published in EMBO Journal (1986)
Abstract
The crystal structure of the complex formed between eglin c, an elastase inhibitor from the medical leech, and subtilisin Carlsberg has been determined at 1.2 A resolution by a combination of Patterson search methods and isomorphous replacement techniques. The structure has been refined to a crystallographic R-value of 0.18 (8-1.2 A). Eglin consists of a four-stranded beta-sheet with an alpha-helical segment and the protease-binding loop fixed on opposite sides. This loop, which contains the reactive site Leu45I--Asp46I, is mainly held in its conformation by unique electrostatic/hydrogen bond interactions of Thr44I and Asp46I with the side chains of Arg53I and Arg51I which protrude from the hydrophobic core of the molecule. The conformation around the reactive site is similar to that found in other proteinase inhibitors. The nine residues of the binding loop Gly40I--Arg48I are involved in direct contacts with subtilisin. In this interaction, eglin segment Pro42I--Thr44I forms a three-stranded anti-parallel beta-sheet with subtilisin segments Gly100--Gly102 and Ser125--Gly127. The reactive site peptide bond of eglin is intact, and Ser221 OG of the enzyme is 2.81 A apart from the carbonyl carbon.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Zusammenfassung
1.2 Å crystal structure of the subtilisin Carlsberg-eglin C complex shows leech eglin C as a four-stranded β-sheet with α-helix and protease-binding loop forming a three-stranded antiparallel β-sheet with subtilisin.
Warum dies für die Hirudotherapie relevant ist
Diese Studie bestimmte die verfeinerte Röntgenkristallstruktur mit 1,2 Å Auflösung des Komplexes aus Eglin c – einem Elastase-Inhibitor aus dem medizinischen Blutegel – und Subtilisin Carlsberg unter Verwendung von Patterson-Such- und isomorphen Ersetzungsmethoden (R-Wert 0,18). Die Struktur zeigt Eglin c als viersträngiges β-Faltblatt mit einem α-helikalen Segment und einer Protease-bindenden Schleife (reaktives Zentrum Leu45I–Asp46I), die durch elektrostatische Wechselwirkungen und Wasserstoffbrücken stabilisiert wird, wobei neun Schleifenreste mit Subtilisin in Kontakt treten und ein dreisträngiges antiparalleles β-Faltblatt bilden; die Peptidbindung des reaktiven Zentrums bleibt intakt. Dies ist für das ASH-Gebiet relevant als hochauflösende strukturelle Charakterisierung eines Protease-Inhibitors aus dem Blutegel-Sekretom. Einschränkung: Dies ist rein strukturell (Röntgenkristallographie) und liefert keine therapeutischen, In-vivo- oder Hirudotherapie-Daten.
Zitation
Refined 1.2 Å crystal structure of the complex formed between subtilisin Carlsberg and the inhibitor eglin c.
Bode W, Papamokos E, Musil D, Seemueller U, Fritz H · The EMBO journal, 1986
Verwandter klinischer Kontext
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Zur ASH-Bibliothek hinzugefügt: May 26, 2026 · Letzte Aktualisierung der Website: 18. Juni 2026