Chromosome-level genome assembly of the cave leech Sinospelaeobdella cavatuses (Hirudinea: Haemadipsidae)
Research article published in Scientific data (2024)
Abstract
Leeches are famous for their high medical value and wide environmental adaptability. Among them, cave leeches are a very fascinating and rare group, which is an important component in the study of adaptive evolution of leeches. However, no study has yet reported a reference genome for this group. In this study, we assembled a high-quality chromosome-level genome of the cave terrestrial leech Sinospelaeobdella cavatuses, through Illumina and PacBio sequencing, alongside chromosome conformation capture techniques. The resulting genome spans 153.67 Mb across 9 pseudochromosomes(range: 11.33 to 23.53 Mb), with a mounting rate of up to 95.37% and features an N50 length of 17.15 Mb. This genome is composed of 35.16% repetitive elements and contains 21180 predicted protein-coding genes. Decoding the S. cavatuses genome not only promotes future studies on study of its phylogeny, evolution, and behavior, but also provides valuable resources for in-depth investigation on adaptive evolution of leech.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Резюме
Leeches are famous for their high medical value and wide environmental adaptability.
Почему это важно для гирудотерапии
В данном исследовании сообщается о первом эталонном геноме высокого качества на хромосомном уровне для пещерной наземной пиявки Sinospelaeobdella cavatuses, собранном с использованием технологий Illumina, PacBio и конформационного захвата хромосом. Геном охватывает 153,67 Мб в 9 псевдохромосомах с показателем сборки 95,37%, N50 17,15 Мб, 35,16% повторяющихся элементов и 21 180 предсказанных генов, кодирующих белки. Для ASH в аннотации отмечается, что пиявки «известны своей высокой медицинской ценностью», что обеспечивает общую основу для включения, хотя конкретно эта пещерная пиявка не описывается как используемая в терапии. Тем не менее, это отчет о сборке генома — он не представляет никакого анализа биологически активных соединений, слюнных антикоагулянтов, терапевтических данных или применений гирудотерапии. Его релевантность для сферы деятельности ASH носит исключительно косвенный характер.
Цитирование
Chromosome-level genome assembly of the cave leech Sinospelaeobdella cavatuses (Hirudinea: Haemadipsidae)
Yao B et al. · Scientific data, 2024
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Добавлено в библиотеку ASH: May 27, 2026 · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.