Recombinant decorsin: dynamics of the RGD recognition site
Research article published in Protein science : a publication of the Protein Society (2000)
Abstract
Decorsin is an antagonist of integrin alphaIIbbeta3 and a potent platelet aggregation inhibitor. A synthetic gene encoding decorsin, originally isolated from the leech Macrobdella decora, was designed, constructed, and expressed in Escherichia coli. The synthetic gene was fused to the stII signal sequence and expressed under the transcriptional control of the E. coli alkaline phosphatase promoter. The protein was purified by size-exclusion filtration of the periplasmic contents followed by reversed-phase high-performance liquid chromatography. Purified recombinant decorsin was found to be indistinguishable from leech-derived decorsin based on amino acid composition, mass spectral analysis, and biological activity assays. Complete sequential assignments of 1H and proton bound 13C resonances were established. Stereospecific assignments of 21 of 25 nondegenerate b-methylene groups were determined. The RGD adhesion site recognized by integrin receptors was found at the apex of a most exposed hairpin loop. The dynamic behavior of decorsin was analyzed using several independent NMR parameters. Although the loop containing the RGD sequence is the most flexible one in decorsin, the conformation of the RGD site itself is more restricted than in other proteins with similar activities.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Резюме
Decorsin is an antagonist of integrin alphaIIbbeta3 and a potent platelet aggregation inhibitor.
Почему это важно для гирудотерапии
Данное исследование описывает рекомбинантную экспрессию, очистку и структурную характеристику декорсина методом ЯМР — мощного антагониста интегрина αIIbβ3 и ингибитора агрегации тромбоцитов, впервые выделенного из пиявки Macrobdella decora. Синтетический ген был экспрессирован в E. coli, и было подтверждено, что рекомбинантный белок неотличим от природного декорсина из пиявок по составу, массе и биологической активности. Сайт узнавания RGD был локализован на вершине экспонированной гибкой шпилечной петли, хотя сама конформация RGD была более ограниченной, чем в сопоставимых белках. Данная работа имеет прямое отношение к области интересов ASH, поскольку она углубляет структурное понимание секретируемого пиявкой антитромботического белка и подтверждает возможность его рекомбинантного производства. Исследование носит чисто биофизический/биохимический характер, без данных in vivo или клинических данных.
Цитирование
Recombinant decorsin: dynamics of the RGD recognition site
Krezel AM et al. · Protein science : a publication of the Protein Society, 2000
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Добавлено в библиотеку ASH: May 27, 2026 · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.