Discovery of a Thrombin-Targeting Anticoagulant Peptide From Whitmania pigra via a Computation-Guided Experimentation Strategy
Research article published in Journal of peptide science (2025)
Abstract
Targeting thrombin to screen safe thrombin inhibitors from natural plants and animals is a critical direction in anticoagulant drug development. This study aimed to screen thrombin inhibitors from the nonbloodsucking leech Whitmania pigra (WP) and elucidate the mechanism of anticoagulation through a "computation-guided experimentation" strategy. A peptide library was constructed from WP hydrolysates, and virtual screening was performed using molecular docking and dynamics simulations. A novel thrombin-targeting anticoagulant peptide PEPWP (LRELEDALEQER) was screened out from the peptide library and validated through in vitro/in vivo experiments. PEPWP significantly prolonged thrombin time (TT) and prothrombin time (PT) in a dose-dependent manner in vitro, indicating its role in the common and extrinsic coagulation pathways. Surface plasmon resonance (SPR) analysis then confirmed strong thrombin binding (Kd = 7.242 × 10-6 mol/L). Furthermore, PEPWP prolonged TT while reducing blood viscosity in acute blood stasis rats. Finally, structural analysis revealed that PEPWP bound to Exosite II of thrombin. Arg233 and Arg101 were the key residues for the binding. In conclusion, PEPWP exhibited good anticoagulant activity and significant application potential.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Резюме
Discovery of a Thrombin-Targeting Anticoagulant Peptide From Whitmania pigra via a Computation-Guided Experimentation Strategy.
Почему это важно для гирудотерапии
В данном исследовании применена стратегия с использованием вычислительных методов — молекулярный докинг и симуляции молекулярной динамики — для скрининга пептидной библиотеки, созданной из гидролизатов некровососущей пиявки Whitmania pigra, с целью поиска новых ингибиторов тромбина. Идентифицированный пептид PEPWP увеличивал тромбиновое и протромбиновое время in vitro, связывался с экзосайтом II тромбина с подтверждённым сродством и снижал вязкость крови на модели острого застоя крови у крыс. Данная работа релевантна для предметной области ASH, поскольку идентифицирует биоактивный антикоагулянтный пептид у вида пиявок, расширяя представления о биоактивных соединениях пиявочного происхождения. Основное ограничение — доклинический характер исследования: все оценки проводились в лабораторных тестах и на животной модели, подтверждения эффективности или безопасности у человека отсутствуют.
Цитирование
Discovery of a Thrombin-Targeting Anticoagulant Peptide From Whitmania pigra via a Computation-Guided Experimentation Strategy
Hua Y et al. · Journal of peptide science, 2025
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Добавлено в библиотеку ASH: May 27, 2026 · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.