NMR-based structural characterization of a two-disulfide-bonded analogue of the FXIIIa inhibitor tridegin
Structural biology published in International Journal of Molecular Sciences (2021)
Abstract
The saliva of blood-sucking leeches contains a plethora of anticoagulant substances. One of these compounds derived from Haementeria ghilianii, the 66mer three-disulfide-bonded peptide tridegin, specifically inhibits the blood coagulation factor FXIIIa. Tridegin represents a potential tool for antithrombotic and thrombolytic therapy. We recently synthesized two-disulfide-bonded tridegin variants, which retained their inhibitory potential. For further lead optimization, however, structure information is required. We thus analyzed the structure of a two-disulfide-bonded tridegin isomer by solution 2D NMR spectroscopy in a combinatory approach with subsequent MD simulations. The isomer was studied using two fragments, i.e., the disulfide-bonded N-terminal (Lys1-Cys37) and the flexible C-terminal part (Arg38-Glu66), which allowed for a simplified, label-free NMR-structure elucidation of the 66mer peptide. The structural information was subsequently used in molecular modeling and docking studies to provide insights into the structure-activity relationships. The present study will prospectively support the development of anticoagulant-therapy-relevant compounds targeting FXIIIa.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Resumen
NMR structural characterization of two-disulfide tridegin variants reveals key folds for FXIIIa inhibition — insights for next-generation leech-derived inhibitor design.
Por qué esto importa para la hirudoterapia
Este estudio informa la estructura mediante RMN en solución de un análogo con dos enlaces disulfuro de la tridegina, un péptido de 66 aminoácidos de la sanguijuela Haementeria ghilianii que inhibe específicamente el factor de la coagulación sanguínea FXIIIa, utilizando un enfoque de dos fragmentos combinado con simulaciones de dinámica molecular. El trabajo es relevante para la hirudoterapia y el secretoma de la sanguijuela porque impulsa la optimización de un compuesto líder antitrombótico/trombolítico derivado de sanguijuela hacia un potencial desarrollo terapéutico dirigido al FXIIIa. Los datos estructurales respaldan estudios de modelado molecular y acoplamiento orientados a comprender las relaciones estructura-actividad. La advertencia honesta es que se trata de un estudio biofísico preclínico; no involucra animales ni sujetos humanos, no incluye terapia con sanguijuelas, y la relevancia terapéutica es prospectiva: el resumen no afirma eficacia clínica ni aprobación de la FDA.
Citación
NMR-based structural characterization of a two-disulfide-bonded analogue of the FXIIIa inhibitor tridegin.
Schmitz T et al. · International journal of molecular sciences, 2021
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Añadido a la biblioteca ASH: May 27, 2026 · Última actualización del sitio: 18 de junio de 2026