Discovery of a Thrombin-Targeting Anticoagulant Peptide From Whitmania pigra via a Computation-Guided Experimentation Strategy
Research article published in Journal of peptide science (2025)
Abstract
Targeting thrombin to screen safe thrombin inhibitors from natural plants and animals is a critical direction in anticoagulant drug development. This study aimed to screen thrombin inhibitors from the nonbloodsucking leech Whitmania pigra (WP) and elucidate the mechanism of anticoagulation through a "computation-guided experimentation" strategy. A peptide library was constructed from WP hydrolysates, and virtual screening was performed using molecular docking and dynamics simulations. A novel thrombin-targeting anticoagulant peptide PEPWP (LRELEDALEQER) was screened out from the peptide library and validated through in vitro/in vivo experiments. PEPWP significantly prolonged thrombin time (TT) and prothrombin time (PT) in a dose-dependent manner in vitro, indicating its role in the common and extrinsic coagulation pathways. Surface plasmon resonance (SPR) analysis then confirmed strong thrombin binding (Kd = 7.242 × 10-6 mol/L). Furthermore, PEPWP prolonged TT while reducing blood viscosity in acute blood stasis rats. Finally, structural analysis revealed that PEPWP bound to Exosite II of thrombin. Arg233 and Arg101 were the key residues for the binding. In conclusion, PEPWP exhibited good anticoagulant activity and significant application potential.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Zusammenfassung
Discovery of a Thrombin-Targeting Anticoagulant Peptide From Whitmania pigra via a Computation-Guided Experimentation Strategy.
Warum dies für die Hirudotherapie relevant ist
Diese Studie verwendete eine computergestützte Strategie – mittels Molecular Docking und Dynamiksimulationen –, um eine Peptidbibliothek, die aus Hydrolysaten des nicht blutsaugenden Blutegels Whitmania pigra konstruiert wurde, auf neuartige Thrombininhibitoren zu durchsuchen. Das identifizierte Peptid PEPWP verlängerte in vitro die Thrombinzeit und die Prothrombinzeit, band mit bestätigter Affinität an Exosite II von Thrombin und reduzierte die Blutviskosität in einem akuten Blutstase-Rattenmodell. Diese Arbeit ist für den ASH-Bereich relevant, da sie ein bioaktives antikoagulatorisches Peptid aus einer Blutegelart identifiziert und das Verständnis bioaktiver, aus Blutegeln gewonnener Verbindungen erweitert. Die wesentliche Einschränkung besteht in deren präklinischem Charakter: Alle Evaluierungen wurden in Laborassays und einem Tiermodell durchgeführt, ohne menschliche Validierung von Wirksamkeit oder Sicherheit.
Zitation
Discovery of a Thrombin-Targeting Anticoagulant Peptide From Whitmania pigra via a Computation-Guided Experimentation Strategy
Hua Y et al. · Journal of peptide science, 2025
Verwandter klinischer Kontext
Erfahren Sie, wie diese Forschung mit der klinischen Praxis verknüpft ist
Zur ASH-Bibliothek hinzugefügt: May 27, 2026 · Letzte Aktualisierung der Website: 18. Juni 2026