Struktur des Blutegelproteins Saratin und Charakterisierung seiner Bindung an Kollagen

The leech protein Saratin from Hirudo medicinalis prevents thrombocyte aggregation by interfering with the first binding step of the thrombocytes to collagen by binding to collagen. We solved the three-dimensional structure of the leech protein Saratin in solution and identified its collagen binding site by NMR titration experiments. The NMR structure of Saratin consists of one alpha-helix and a five-stranded beta-sheet arranged in the topology betabetaalphabetabetabeta. The C-terminal region, of about 20 amino acids in length, adopts no regular structure. NMR titration experiments with collagen peptides show that the collagen interaction of Saratin takes place in a kind of notch that is formed by the end of the alpha-helix and the beta-sheet. NMR data-driven docking experiments to collagen model peptides were used to elucidate the putative binding mode of Saratin and collagen. Mainly, parts of the first and the end of the fifth beta-strand, the loop connecting the alpha-helix and the third beta-strand, and a short part of the loop connecting the fourth and fifth beta-strand participate in binding.

Abstract aus PubMed (NCBI) für den zitierten Eintrag, in der Originalsprache wiedergegeben. Maßgeblich ist die Fassung der Originalpublikation.

Das Abstract wird nicht übersetzt, damit die eigene Wortwahl der Autoren erhalten bleibt.

Saratin aus Hirudo medicinalis hemmt die Thrombozytenaggregation, indem es Kollagen bindet und damit den ersten Bindungsschritt der Thrombozyten an Kollagen stört. Die in Lösung aufgeklärte dreidimensionale Struktur besteht aus einer α-Helix und einem fünfsträngigen β-Faltblatt (Topologie ββαβββ); mittels NMR-Titration wurde die Kollagenbindungsstelle in einer Kerbe zwischen Helixende und β-Faltblatt lokalisiert. Docking-Experimente legen nahe, dass vor allem Teile des ersten und das Ende des fünften β-Strangs sowie zwei Schleifen an der Bindung beteiligt sind.

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