Flexibility of the thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor pro-domain enables productive binding of protein substrates
Research article published in The Journal of biological chemistry (2010)
Abstract
We have previously reported that thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI) exhibits intrinsic proteolytic activity toward large peptides. The structural basis for this observation was clarified by the crystal structures of human and bovine TAFI. These structures evinced a significant rotation of the pro-domain away from the catalytic moiety when compared with other pro-carboxypeptidases, thus enabling access of large peptide substrates to the active site cleft. Here, we further investigated the flexible nature of the pro-domain and demonstrated that TAFI forms productive complexes with protein carboxypeptidase inhibitors from potato, leech, and tick (PCI, LCI, and TCI, respectively). We determined the crystal structure of the bovine TAFI-TCI complex, revealing that the pro-domain was completely displaced from the position observed in the TAFI structure. It protruded into the bulk solvent and was disordered, whereas TCI occupied the position previously held by the pro-domain. The authentic nature of the presently studied TAFI-inhibitor complexes was supported by the trimming of the C-terminal residues from the three inhibitors upon complex formation. This finding suggests that the inhibitors interact with the active site of TAFI in a substrate-like manner. Taken together, these data show for the first time that TAFI is able to form a bona fide complex with protein carboxypeptidase inhibitors. This underlines the unusually flexible nature of the pro-domain and implies a possible mechanism for regulation of TAFI intrinsic proteolytic activity in vivo.
Abstract sourced from PubMed (NCBI) for the cited record. See the original publication for the authoritative version.
Резюме
We have previously reported that thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI) exhibits intrinsic proteolytic activity toward large peptides.
Почему это важно для гирудотерапии
Данное исследование в области структурной биологии посвящено тромбин-активируемому ингибитору фибринолиза (TAFI); показано, что он образует продуктивные комплексы с ингибиторами карбоксипептидаз белковой природы из картофеля, пиявки и клеща (PCI, LCI и TCI). Исследователи определили кристаллическую структуру комплекса бычьего TAFI с TCI, которая выявила, что пропептидный домен полностью смещён и разупорядочен, тогда как ингибитор занимает положение, ранее занимаемое пропептидным доменом, при этом С-концевые остатки всех трёх ингибиторов укорачиваются при образовании комплекса. Это исследование релевантно Американскому обществу гирудотерапии, поскольку оно предоставляет структурные доказательства того, что ингибитор карбоксипептидазы из пиявки (LCI) способен образовывать полноценный комплекс с TAFI — регулятором фибринолиза. Однако результаты ограничены методами in vitro кристаллографии, а детальная кристаллическая структура была определена только для комплекса TAFI–TCI, но не для TAFI–LCI.
Цитирование
Flexibility of the thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor pro-domain enables productive binding of protein substrates
Valnickova Z et al. · The Journal of biological chemistry, 2010
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Добавлено в библиотеку ASH: May 27, 2026 · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.