Пространственная регуляция преобладает над функцией генов в цепи ганглиев

MOTIVATION: To understand the molecular mechanisms of neurons, it is imperative to identify genomic dissimilarities within the heterogeneity of the neural system. This is especially true for neuronal disorders in which spatial considerations are of critical nature. For this purpose, Hirudo medicinalis provides here an ideal system in which we are able to follow gene expression along the central nervous system, to affiliate location with gene behavior. RESULTS: In all, 221.1 million high-quality short reads were sequenced on the Illumina Hiseq2000 platform at the single ganglion level. Thereafter, a de novo assembly was performed using two state-of-the-art assemblers, Trinity and Trans-ABySS, to reconstruct a comprehensive de novo transcriptome. Classification of Trinity and Trans-ABySS transcripts produced a non-redundant set of 76 845 and 268 355 transcripts (>200 bp), respectively. Remarkably, using Trinity, 82% of the published medicinal leech messenger RNAs was identified. For the innexin family, all of the 21 recently reported genes were identified. Spatial regulation analysis across three ganglia throughout the entire central nervous system revealed distinct patterns of gene expression. These transcriptome data were combined with expression distribution to produce a spatio-transcripto map along the ganglia chain. This study provides a resource for gene discovery and gene regulation in future studies.

Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.

Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.

На модели Hirudo medicinalis на уровне отдельных ганглиев секвенировано 221,1 млн высококачественных коротких прочтений (Illumina HiSeq2000); транскриптом собран de novo двумя ассемблерами (Trinity, Trans-ABySS), давшими 76 845 и 268 355 транскриптов (>200 п.н.). Транскрипты Trinity покрывали 82 % опубликованных мРНК медицинской пиявки и все 21 ген семейства иннексинов. Анализ трёх ганглиев вдоль всей центральной нервной системы выявил отчётливо различные профили экспрессии генов и позволил построить пространственно-транскриптомную карту цепочки ганглиев — ресурс для будущих исследований генов и их регуляции.

Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой

Другие рецензируемые исследования в разделе «Геномика и протеомика».

• Leech Salivary Proteome and Transcriptome: 434 Deduced Protein Sequences — Liu Z, Tong X, Su Y, et al. (2019)
• Medicinal Leech Draft Genome — Anticoagulant Gene Survey — Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME (2020)
• Влияние гирудотерапии на функции печени, липидный профиль и чувствительность к инсулину у крыс с метаболическим синдромом — Bilden A et al. (2026)
• Эффективность и безопасность гирудотерапии для улучшения показателей качества спермы при мужском бесплодии: рандомизированное контролируемое исследование — Abtahi-Forooshani M et al. (2026)
• Гирудотерапия при заживлении ран — Nair H et al. (2022)
• Медицинские пиявки и гирудотерапия — Gödekmerdan A et al. (2011)
• Кожная псевдолимфома после гирудотерапии: клинический случай и обзор — Hanner S et al. (2022)
• Гирудотерапия при ранней пресбиакузии у ликвидаторов аварии на Чернобыльской АЭС в поставарийные годы — Zabolotnyi D, Mishchanchuk N (2019)
• Гирудотерапия (медицинские пиявки) в лечении обструкции верхних дыхательных путей у собаки — Trenholme H, Masseau I, Reinero C (2021)
• Лечение пиявками — Yantis M, O'Toole K, Ring P (2009)

Все исследования, проанализированные ASH →