ДНК, полученная из кровяного содержимого пиявок (invertebrate-derived DNA), выявляет различия в разнообразии млекопитающих Борнео между местообитаниями

The application of metabarcoding to environmental and invertebrate-derived DNA (eDNA and iDNA) is a new and increasingly applied method for monitoring biodiversity across a diverse range of habitats. This approach is particularly promising for sampling in the biodiverse humid tropics, where rapid land-use change for agriculture means there is a growing need to understand the conservation value of the remaining mosaic and degraded landscapes. Here we use iDNA from blood-feeding leeches (Haemadipsa picta) to assess differences in mammalian diversity across a gradient of forest degradation in Sabah, Malaysian Borneo. We screened 557 individual leeches for mammal DNA by targeting fragments of the 16S rRNA gene and detected 14 mammalian genera. We recorded lower mammal diversity in the most heavily degraded forest compared to higher quality twice logged forest. Although the accumulation curves of diversity estimates were comparable across these habitat types, diversity was higher in twice logged forest, with more taxa of conservation concern. In addition, our analysis revealed differences between the community recorded in the heavily logged forest and that of the twice logged forest. By revealing differences in mammal diversity across a human-modified tropical landscape, our study demonstrates the value of iDNA as a noninvasive biomonitoring approach in conservation assessments.

Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.

Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.

В полевом исследовании в Сабахе (Малайзийский Борнео) оценивали разнообразие млекопитающих по ДНК, выделенной из 557 кровососущих пиявок Haemadipsa picta (фрагменты гена 16S рРНК). Обнаружено 14 родов млекопитающих; в наиболее деградированном лесу разнообразие было ниже, чем в дважды вырубленном лесу лучшего качества, при сопоставимых кривых накопления. Сообщества интенсивно вырубленного и дважды вырубленного леса различались, причём во втором таксонов, представляющих природоохранный интерес, было больше. Авторы заключают, что ДНК, полученная от беспозвоночных (iDNA), — ценный неинвазивный подход к биомониторингу в природоохранной оценке.

Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой

Другие рецензируемые исследования в разделе «Геномика и протеомика».

• Leech Salivary Proteome and Transcriptome: 434 Deduced Protein Sequences — Liu Z, Tong X, Su Y, et al. (2019)
• Medicinal Leech Draft Genome — Anticoagulant Gene Survey — Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME (2020)
• Лечение пиявками (Hirudo medicinalis) ослабляет повреждения яичка, вызванные ишемией/реперфузией яичка, на экспериментальной модели у животных — Davoodi F et al. (2021)
• Новый антикоагулянтный белок из медицинской пиявки — Manuvera V et al. (2024)
• AIF-1 и RNASET2 играют комплементарные роли во врождённом иммунном ответе медицинской пиявки — Baranzini N et al. (2019)
• Антимикробные пептиды медицинской пиявки, не обладающие токсичностью, — перспективная альтернативная стратегия борьбы с патогенами, устойчивыми к антибиотикам — Grafskaia E et al. (2019)
• Структурные основы тромболитической активности дестабилазы медицинской пиявки — Marin E et al. (2023)
• Геном медицинской пиявки (Whitmania pigra) и сравнительное геномное исследование для поиска биологически активных веществ — Tong L et al. (2022)
• ЦНС медицинской пиявки как модель изучения экзосом во взаимодействии между микроглией и нейронами — Raffo-Romero A et al. (2018)
• Транскриптомное профилирование и первый анализ пространственной экспрессии генов-кандидатов в слюнной железе восточноазиатской медицинской пиявки Hirudo nipponia — Kim J et al. (2024)

Все исследования, проанализированные ASH →