Последовательность генома пресноводной пиявки Erpobdella octoculata (Linnaeus, 1758) (Hirudinida: Erpobdellidae)
The genome sequence of the freshwater leech Erpobdella octoculata (Linnaeus, 1758) (Hirudinida: Erpobdellidae)
Описание геномной сборки в журнале Wellcome Open Res (2025)
Аннотация
We present a genome assembly from an individual Erpobdella octoculata (leeches; Annelida; Clitellata; Hirudinida; Erpobdellidae). The genome sequence has a total length of 386.12 megabases. Most of the assembly (98.81%) is scaffolded into 10 chromosomal pseudomolecules. The mitochondrial genome has also been assembled, with a length of 19.12 kilobases. Gene annotation of this assembly on Ensembl identified 19 465 protein-coding genes. This assembly was generated as part of the Darwin Tree of Life project, which produces reference genomes for eukaryotic species found in Britain and Ireland.
Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.
Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.
Резюме
В рамках проекта Darwin Tree of Life, создающего референсные геномы эукариот Великобритании и Ирландии, представлена сборка генома пресноводной пиявки Erpobdella octoculata (Hirudinida: Erpobdellidae), полученная от одной особи. Общая длина геномной последовательности составила 386,12 Мб; 98,81% сборки организованы в 10 хромосомных псевдомолекул. Дополнительно собран митохондриальный геном, его длина составила 19,12 кб. Аннотация сборки в базе данных Ensembl выявила 19 465 генов, кодирующих белки.
Почему это важно для гирудотерапии
Данная статья представляет сборку генома особи Erpobdella octoculata (пиявки; Annelida; Clitellata; Hirudinida; Erpobdellidae) общей длиной 386,12 мегабаз, с 98,81% последовательностей, собранных в 10 хромосомных псевдомолекул, митохондриальным геномом размером 19,12 т.п.н. и 19 465 аннотированными генами, кодирующими белки, созданную в рамках проекта Darwin Tree of Life по созданию эталонных геномов для эукариот Великобритании и Ирландии. Значимость для гирудотерапии является косвенной: аннотация описывает только сборку генома вида пиявки и не упоминает слюнные антикоагулянты, терапевтические соединения, гирудотерапию или какие-либо клинические применения. Не представлено данных о биоактивных молекулах или медицинском использовании, поэтому любая терапевтическая связь носила бы спекулятивный характер.
Цитирование
Библиографическая ссылка (стиль Vancouver)
Skipp SJ, Morrise A, Natural History Museum Genome Acquisition Lab, Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory team, Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations, Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics team, et al. The genome sequence of the freshwater leech Erpobdella octoculata (Linnaeus, 1758) (Hirudinida: Erpobdellidae). Wellcome Open Res. 2025;10:660. doi:10.12688/wellcomeopenres.25215.1. PMID: 41660135
Библиографические данные (авторы, том, страницы, DOI) взяты из записи PubMed.
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Похожие исследования
Другие рецензируемые исследования в разделе «Геномика и протеомика».
- Leech Salivary Proteome and Transcriptome: 434 Deduced Protein Sequences — Liu Z, Tong X, Su Y, et al. (2019)
- Medicinal Leech Draft Genome — Anticoagulant Gene Survey — Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME (2020)
- Лечение пиявками (Hirudo medicinalis) ослабляет повреждения яичка, вызванные ишемией/реперфузией яичка, на экспериментальной модели у животных — Davoodi F et al. (2021)
- Новый антикоагулянтный белок из медицинской пиявки — Manuvera V et al. (2024)
- AIF-1 и RNASET2 играют комплементарные роли во врождённом иммунном ответе медицинской пиявки — Baranzini N et al. (2019)
- Антимикробные пептиды медицинской пиявки, не обладающие токсичностью, — перспективная альтернативная стратегия борьбы с патогенами, устойчивыми к антибиотикам — Grafskaia E et al. (2019)
- Структурные основы тромболитической активности дестабилазы медицинской пиявки — Marin E et al. (2023)
- Геном медицинской пиявки (Whitmania pigra) и сравнительное геномное исследование для поиска биологически активных веществ — Tong L et al. (2022)
- ЦНС медицинской пиявки как модель изучения экзосом во взаимодействии между микроглией и нейронами — Raffo-Romero A et al. (2018)
- Транскриптомное профилирование и первый анализ пространственной экспрессии генов-кандидатов в слюнной железе восточноазиатской медицинской пиявки Hirudo nipponia — Kim J et al. (2024)
Добавлено в библиотеку ASH: 27 мая 2026 г. · Последнее обновление сайта: 18 июня 2026 г.