Применение ДНК-штрихкодирования на основе беспозвоночных (iDNA) у кровососущих пиявок Западной Суматры: обнаружение голубоглазой лягушки лесной подстилки Leptobrachium waysapuntiense

Indonesia is one of the world's most biodiversity-rich countries, including a wide variety of vertebrate and plant species. However, assessing biodiversity in tropical rainforests remains challenging itself. The use of conventional tools has commonly been employed for monitoring and research purposes. Invertebrate-derived DNA (iDNA), a subdiscipline of environmental DNA (eDNA), has emerged as a noninvasive tool that complements traditional methods for biodiversity assessment. It enables the detection of vertebrate species and the monitoring of their populations through molecular approaches. Utilizing abundant haematophagous leeches provides a promising approach to sample a broader range of host species within an area, as these leeches retain high-quality host DNA in their guts for extended periods. Using Sanger sequencing with five primer sets (16Scp, 16Sed, 12S, ND2, and RepCOI) designed to target broad taxonomic groups, 272 Haemadipsa spp. samples were successfully amplified, resulting in the identification of 17 unique vertebrate hosts, including mammals, amphibians, and reptiles. Within our 16Sed results, we noted that the primer sets could capture a broader range of taxa than originally targeted, encompassing both mammals and reptiles, thereby enhancing species richness detection. Notably, we present evidence of the first iDNA-based detection of the rare blue-eyed litter frog, Leptobrachium waysepuntiense, from western Sumatra. Therefore, this study suggests that the use of haematophagous leeches represents a promising approach for biodiversity monitoring in Indonesia. This method offers a complementary strategy that can be integrated with existing practices to strengthen conservation efforts.

Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.

Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.

Методом секвенирования по Сэнгеру с пятью наборами праймеров (16Scp, 16Sed, 12S, ND2 и RepCOI) проанализированы 272 образца Haemadipsa spp. из Западной Суматры и идентифицированы 17 уникальных хозяев-позвоночных — млекопитающих, амфибий и рептилий. Набор праймеров 16Sed захватывал более широкий спектр таксонов, чем предполагалось изначально. Впервые методом iDNA обнаружена редкая голубоглазая подстилочная лягушка Leptobrachium waysepuntiense. Авторы предполагают, что использование кровососущих пиявок — перспективный подход для мониторинга биоразнообразия в Индонезии.

Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой

Другие рецензируемые исследования в разделе «Геномика и протеомика».

• Leech Salivary Proteome and Transcriptome: 434 Deduced Protein Sequences — Liu Z, Tong X, Su Y, et al. (2019)
• Medicinal Leech Draft Genome — Anticoagulant Gene Survey — Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME (2020)
• Лечение пиявками (Hirudo medicinalis) ослабляет повреждения яичка, вызванные ишемией/реперфузией яичка, на экспериментальной модели у животных — Davoodi F et al. (2021)
• Новый антикоагулянтный белок из медицинской пиявки — Manuvera V et al. (2024)
• AIF-1 и RNASET2 играют комплементарные роли во врождённом иммунном ответе медицинской пиявки — Baranzini N et al. (2019)
• Антимикробные пептиды медицинской пиявки, не обладающие токсичностью, — перспективная альтернативная стратегия борьбы с патогенами, устойчивыми к антибиотикам — Grafskaia E et al. (2019)
• Структурные основы тромболитической активности дестабилазы медицинской пиявки — Marin E et al. (2023)
• Геном медицинской пиявки (Whitmania pigra) и сравнительное геномное исследование для поиска биологически активных веществ — Tong L et al. (2022)
• ЦНС медицинской пиявки как модель изучения экзосом во взаимодействии между микроглией и нейронами — Raffo-Romero A et al. (2018)
• Транскриптомное профилирование и первый анализ пространственной экспрессии генов-кандидатов в слюнной железе восточноазиатской медицинской пиявки Hirudo nipponia — Kim J et al. (2024)

Все исследования, проанализированные ASH →