Уточнённая кристаллическая структура комплекса субтилизина Carlsberg с ингибитором эглином c при разрешении 1,2 Å. Молекулярная структура эглина и его детальное взаимодействие с субтилизином

The crystal structure of the complex formed between eglin c, an elastase inhibitor from the medical leech, and subtilisin Carlsberg has been determined at 1.2 A resolution by a combination of Patterson search methods and isomorphous replacement techniques. The structure has been refined to a crystallographic R-value of 0.18 (8-1.2 A). Eglin consists of a four-stranded beta-sheet with an alpha-helical segment and the protease-binding loop fixed on opposite sides. This loop, which contains the reactive site Leu45I--Asp46I, is mainly held in its conformation by unique electrostatic/hydrogen bond interactions of Thr44I and Asp46I with the side chains of Arg53I and Arg51I which protrude from the hydrophobic core of the molecule. The conformation around the reactive site is similar to that found in other proteinase inhibitors. The nine residues of the binding loop Gly40I--Arg48I are involved in direct contacts with subtilisin. In this interaction, eglin segment Pro42I--Thr44I forms a three-stranded anti-parallel beta-sheet with subtilisin segments Gly100--Gly102 and Ser125--Gly127. The reactive site peptide bond of eglin is intact, and Ser221 OG of the enzyme is 2.81 A apart from the carbonyl carbon.

Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.

Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.

Методами поиска Паттерсона и изоморфного замещения определена кристаллическая структура комплекса эглина c — ингибитора эластазы из медицинской пиявки — с субтилизином Carlsberg при разрешении 1,2 Å и уточнена до R-фактора 0,18 (8–1,2 Å). Эглин состоит из четырёхцепочечного β-листа с α-спиральным участком и петлёй связывания протеазы на противоположных сторонах; петля содержит реакционный центр Leu45I–Asp46I. Девять остатков петли Gly40I–Arg48I контактируют с субтилизином; связь реакционного центра интактна, а OG Ser221 удалена от карбонильного углерода на 2,81 Å.

Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой

Другие рецензируемые исследования в разделе «Фармакология секрета слюнных желёз».

• Медицинские пиявки и гирудотерапия — Gödekmerdan A et al. (2011)
• Перекисное окисление липидов слюны у пациентов с постковидным синдромом на фоне гирудотерапии — Serikbayeva S et al. (2024)
• Лечение медицинскими пиявками при болевых синдромах: нарративный обзор — Koeppen D, Aurich M, Rampp T (2014)
• Иммуномодулирующие эффекты экстракта слюны медицинской пиявки на активированные макрофаги in vitro — Ayhan H et al. (2024)
• Ингибиторы протеиназ медицинской пиявки Hirudo medicinalis — Baskova I, Zavalova L (2001)
• Полифункциональность дестабилазы — лизоцима медицинской пиявки — Baskova I, Zavalova L (2008)
• «Удвоение»: идентификация и характеристика тандем-гирудина из азиатской медицинской пиявки Hirudinaria manillensis — Lukas P et al. (2022)
• Применение медицинской пиявки в лечении заболеваний уха — Seleznev K et al. (1992)
• Рекомбинантная дестабилаза из Hirudo medicinalis способна растворять тромбы человека in vitro — Bobrovsky P et al. (2021)
• Влияние рассеяния углеродных нанотрубок в окружающей среде на водного беспозвоночного Hirudo medicinalis — Girardello R et al. (2015)

Все исследования, проанализированные ASH →