Черновая версия генома европейской медицинской пиявки Hirudo medicinalis (Annelida, Clitellata, Hirudiniformes) с акцентом на антикоагулянты
Draft genome of the European medicinal leech Hirudo medicinalis (Annelida, Clitellata, Hirudiniformes) with emphasis on anticoagulants
Геномное исследование в журнале Scientific reports (2020)
Аннотация
The European medicinal leech has been used for medicinal purposes for millennia, and continues to be used today in modern hospital settings. Its utility is granted by the extremely potent anticoagulation factors that the leech secretes into the incision wound during feeding and, although a handful of studies have targeted certain anticoagulants, the full range of anticoagulation factors expressed by this species remains unknown. Here, we present the first draft genome of the European medicinal leech, Hirudo medicinalis, and estimate that we have sequenced between 79-94% of the full genome. Leveraging these data, we searched for anticoagulation factors across the genome of H. medicinalis. Following orthology determination through a series of BLAST searches, as well as phylogenetic analyses, we estimate that fully 15 different known anticoagulation factors are utilized by the species, and that 17 other proteins that have been linked to antihemostasis are also present in the genome. We underscore the utility of the draft genome for comparative studies of leeches and discuss our results in an evolutionary context.
Аннотация взята из PubMed (NCBI) для цитируемой записи и приводится на языке оригинала. Авторитетной является версия в исходной публикации.
Аннотация оставлена без перевода, чтобы сохранить собственные формулировки авторов.
Резюме
Медицинское применение европейской медицинской пиявки Hirudo medicinalis обусловлено мощными антикоагулянтами, однако полный их состав оставался неизвестным. Представлена первая черновая версия генома вида: по оценкам, секвенировано от 79 до 94 % полного генома. С помощью серии BLAST-поисков и филогенетического анализа установлено, что пиявка использует 15 известных антикоагулянтных факторов, а в геноме присутствуют ещё 17 белков, связанных с антигемостазом. Авторы подчёркивают ценность генома для сравнительных исследований пиявок и обсуждают результаты в эволюционном контексте.
Почему это важно для гирудотерапии
Это исследование представляет первый черновой геном европейской медицинской пиявки Hirudo medicinalis, охватывающий по оценкам 79–94% полного генома, и использует поиск ортологов на основе BLAST и филогенетические анализы для идентификации кодируемых в нем факторов антикоагуляции. Авторы сообщают о 15 известных факторах антикоагуляции и 17 дополнительных белках, связанных с антигемостазом, представляя наиболее полную на сегодняшний день геномную инвентаризацию молекулярных агентов, лежащих в основе терапевтического применения этого вида. Для гирудотерапии и изучения секретома слюнных желез пиявки этот ресурс является фундаментальным, обеспечивая возможность сравнительных геномных исследований разных видов пиявок и углубляя механистическое понимание того, как H. medicinalis достигает своих мощных антикоагулянтных эффектов во время питания. Однако идентифицированные кандидаты основаны на гомологии последовательностей и биоинформатическом предсказании, а не на функциональной валидации или продемонстрированной секреции, а геном остается неполным (до ~21% не засеквенировано). В исследовании не оценивается экспрессия белков, их активность или клиническая эффективность, поэтому значимость данной работы заключается преимущественно в использовании в качестве референсного генома и программы для будущих функциональных исследований.
Цитирование
Библиографическая ссылка (стиль Vancouver)
Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME. Draft genome of the European medicinal leech Hirudo medicinalis (Annelida, Clitellata, Hirudiniformes) with emphasis on anticoagulants. Sci Rep. 2020;10(1):9885. doi:10.1038/s41598-020-66749-5. PMID: 32555498
Библиографические данные (авторы, том, страницы, DOI) взяты из записи PubMed.
Связанный клинический контекст
Узнайте, как это исследование связано с клинической практикой
Похожие исследования
Другие рецензируемые исследования в разделе «Геномика и протеомика».
- Leech Salivary Proteome and Transcriptome: 434 Deduced Protein Sequences — Liu Z, Tong X, Su Y, et al. (2019)
- Medicinal Leech Draft Genome — Anticoagulant Gene Survey — Kvist S, Manzano-Marín A, de Carle D, Trontelj P, Siddall ME (2020)
- Лечение пиявками (Hirudo medicinalis) ослабляет повреждения яичка, вызванные ишемией/реперфузией яичка, на экспериментальной модели у животных — Davoodi F et al. (2021)
- Новый антикоагулянтный белок из медицинской пиявки — Manuvera V et al. (2024)
- AIF-1 и RNASET2 играют комплементарные роли во врождённом иммунном ответе медицинской пиявки — Baranzini N et al. (2019)
- Антимикробные пептиды медицинской пиявки, не обладающие токсичностью, — перспективная альтернативная стратегия борьбы с патогенами, устойчивыми к антибиотикам — Grafskaia E et al. (2019)
- Структурные основы тромболитической активности дестабилазы медицинской пиявки — Marin E et al. (2023)
- Геном медицинской пиявки (Whitmania pigra) и сравнительное геномное исследование для поиска биологически активных веществ — Tong L et al. (2022)
- ЦНС медицинской пиявки как модель изучения экзосом во взаимодействии между микроглией и нейронами — Raffo-Romero A et al. (2018)
- Транскриптомное профилирование и первый анализ пространственной экспрессии генов-кандидатов в слюнной железе восточноазиатской медицинской пиявки Hirudo nipponia — Kim J et al. (2024)
Добавлено в библиотеку ASH: 18 марта 2026 г. · Последнее обновление сайта: 1 ноября 2026 г.