Descubrimiento de un péptido anticoagulante dirigido a la trombina a partir de Whitmania pigra mediante una estrategia de «experimentación guiada por computación»

Targeting thrombin to screen safe thrombin inhibitors from natural plants and animals is a critical direction in anticoagulant drug development. This study aimed to screen thrombin inhibitors from the nonbloodsucking leech Whitmania pigra (WP) and elucidate the mechanism of anticoagulation through a "computation-guided experimentation" strategy. A peptide library was constructed from WP hydrolysates, and virtual screening was performed using molecular docking and dynamics simulations. A novel thrombin-targeting anticoagulant peptide PEPWP (LRELEDALEQER) was screened out from the peptide library and validated through in vitro/in vivo experiments. PEPWP significantly prolonged thrombin time (TT) and prothrombin time (PT) in a dose-dependent manner in vitro, indicating its role in the common and extrinsic coagulation pathways. Surface plasmon resonance (SPR) analysis then confirmed strong thrombin binding (Kd = 7.242 × 10-6 mol/L). Furthermore, PEPWP prolonged TT while reducing blood viscosity in acute blood stasis rats. Finally, structural analysis revealed that PEPWP bound to Exosite II of thrombin. Arg233 and Arg101 were the key residues for the binding. In conclusion, PEPWP exhibited good anticoagulant activity and significant application potential.

Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.

El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.

Se cribó computacionalmente una biblioteca de péptidos de Whitmania pigra, sanguijuela no hematófaga; PEPWP (LRELEDALEQER) se validó experimentalmente. PEPWP prolongó de forma significativa y dosis-dependiente los tiempos de trombina (TT) y de protrombina, se unió fuertemente a la trombina (Kd = 7,242 × 10⁻⁶ mol/L) y en ratas con estasis sanguínea aguda prolongó el TT y redujo la viscosidad sanguínea. Se une al exosito II (residuos clave Arg233 y Arg101). Los autores destacan su actividad anticoagulante y potencial de aplicación.

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