VoronaGasyCodes: una base de datos pública de códigos de barras mitocondriales para las aves malgaches

Molecular tools are increasingly being used to survey the presence of biodiversity and their interactions within ecosystems. Indirect methods, like environmental DNA (eDNA) and invertebrate-derived DNA (iDNA), are dependent on sequence databases with accurate and sufficient taxonomic representation. These methods are increasingly being used in regions and habitats where direct detection or observations can be difficult for a variety of reasons. Madagascar is a biodiversity hotspot with a high proportion of endemic species, many of which are threatened or endangered. Here we describe a new resource, VoronaGasyCodes, a curated database of newly published genetic sequences from Malagasy birds. Our database is currently populated with six mitochondrial genes or DNA barcodes for 142 species including 70% of the birds endemic to the island and will be periodically updated as new data become available. We demonstrate the utility of our database with an iDNA study of leech blood meals where we successfully identified 77% of the hosts to species. These types of resources for characterising biodiversity are critical for insights into species distribution, discovery of new taxa, novel ecological connections and advancing conservation and restoration measures.

Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.

El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.

Se presenta VoronaGasyCodes, base de datos curada de secuencias genéticas recién publicadas de aves malgaches. Contiene seis genes mitocondriales o códigos de barras de ADN de 142 especies, incluido el 70 % de las aves endémicas, y se actualizará periódicamente. Su utilidad se demostró con un estudio de iDNA sobre comidas de sangre de sanguijuelas que identificó el 77 % de los hospedadores hasta especie. Según los autores, estos recursos son clave para conocer la distribución, hallar taxones y conservar.

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