Genómica comparada de anélidos y la evolución del reordenamiento genómico masivo específico de linaje en bilaterios
Annelid Comparative Genomics and the Evolution of Massive Lineage-Specific Genome Rearrangement in Bilaterians
Estudio genómico comparativo en la revista Molecular biology and evolution (2024)
Resumen
The organization of genomes into chromosomes is critical for processes such as genetic recombination, environmental adaptation, and speciation. All animals with bilateral symmetry inherited a genome structure from their last common ancestor that has been highly conserved in some taxa but seemingly unconstrained in others. However, the evolutionary forces driving these differences and the processes by which they emerge have remained largely uncharacterized. Here, we analyze genome organization across the phylum Annelida using 23 chromosome-level annelid genomes. We find that while many annelid lineages have maintained the conserved bilaterian genome structure, the Clitellata, a group containing leeches and earthworms, possesses completely scrambled genomes. We develop a rearrangement index to quantify the extent of genome structure evolution and show that, compared to the last common ancestor of bilaterians, leeches and earthworms have among the most highly rearranged genomes of any currently sampled species. We further show that bilaterian genomes can be classified into two distinct categories-high and low rearrangement-largely influenced by the presence or absence, respectively, of chromosome fission events. Our findings demonstrate that animal genome structure can be highly variable within a phylum and reveal that genome rearrangement can occur both in a gradual, stepwise fashion, or rapid, all-encompassing changes over short evolutionary timescales.
Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.
El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.
Síntesis
Se estudió la organización genómica de 23 anélidos a nivel cromosómico. Muchos linajes conservaron la estructura bilateriana, pero los Clitellata (sanguijuelas y lombrices) mostraron genomas completamente desordenados; frente al último ancestro común de los bilaterios, figuran entre los más reordenados de las especies muestreadas. Los genomas bilaterianos pueden clasificarse en dos categorías (reordenamiento alto o bajo), en gran medida según tengan o no fisiones cromosómicas. La estructura genómica puede variar mucho dentro de un filo, con reordenamientos graduales o rápidos.
Contexto
Este estudio genómico comparativo analizó la organización del genoma a nivel cromosómico en el filo Annelida utilizando 23 genomas, encontrando que Clitellata (sanguijuelas y lombrices de tierra) posee genomas altamente reordenados en comparación con la estructura ancestral conservada de los bilaterales. Los autores desarrollaron un índice de reordenamiento que muestra que los genomas de sanguijuela y lombriz de tierra se encuentran entre los más reordenados muestreados, clasificables en categorías de alto y bajo reordenamiento impulsadas en gran medida por eventos de fisión cromosómica. El resumen no reporta nada sobre anticoagulantes, el secretoma de la sanguijuela, hirudoterapia ni ninguna aplicación terapéutica.
Citación
Referencia (estilo Vancouver)
Lewin TD, Liao IJ, Luo YJ. Annelid Comparative Genomics and the Evolution of Massive Lineage-Specific Genome Rearrangement in Bilaterians. Mol Biol Evol. 2024;41(9). doi:10.1093/molbev/msae172. PMID: 39141777
Los datos bibliográficos (autores, volumen, páginas, DOI) proceden del registro de PubMed.
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