El genoma de la sanguijuela medicinal codifica 21 genes de innexinas: diferentes combinaciones se expresan en neuronas centrales identificadas
The medicinal leech genome encodes 21 innexin genes: different combinations are expressed by identified central neurons
Estudio genómico en la revista Dev Genes Evol (2012)
Resumen
Gap junctional proteins are important components of signaling pathways required for the development and ongoing functions of all animal tissues, particularly the nervous system, where they function in the intracellular and extracellular exchange of small signaling factors and ions. In animals whose genomes have been sufficiently sequenced, large families of these proteins, connexins, pannexins, and innexins, have been found, with 25 innexins in the nematode Caenorhabditis elegans Starich et al. (Cell Commun Adhes 8: 311-314, 2001) and at least 37 connexins in the zebrafish Danio rerio Cruciani and Mikalsen (Biol Chem 388:253-264, 2009). Having recently sequenced the medicinal leech Hirudo verbana genome, we now report the presence of 21 innexin genes in this species, nine more than we had previously reported from the analysis of an EST-derived transcriptomic database Dykes and Macagno (Dev Genes Evol 216: 185-97, 2006); Macagno et al. (BMC Genomics 25:407, 2010). Gene structure analyses show that, depending on the leech innexin gene, they can contain from 0 to 6 introns, with closely related paralogs showing the same number of introns. Phylogenetic trees comparing Hirudo to another distantly related leech species, Helobdella robusta, shows a high degree of orthology, whereas comparison to other annelids shows a relatively low level. Comparisons with other Lophotrochozoans, Ecdyzozoans and with vertebrate pannexins suggest a low number (one to two) of ancestral innexin/pannexins at the protostome/deuterostome split. Whole-mount in situ hybridization for individual genes in early embryos shows that ∼50% of the expressed innexins are detectable in multiple tissues. Expression analyses using quantitative PCR show that ∼70% of the Hirudo innexins are expressed in the nervous system, with most of these detected in early development. Finally, quantitative PCR analysis of several identified adult neurons detects the presence of different combinations of innexin genes, a property that may underlie the participation of these neurons in different adult coupling circuits.
Resumen tomado de PubMed (NCBI) para el registro citado, en el idioma original. La versión de referencia es la de la publicación original.
El resumen se deja sin traducir para conservar la redacción original de los autores.
Síntesis
En el genoma de la sanguijuela medicinal Hirudo verbana se identificaron 21 genes de innexinas, que contienen de 0 a 6 intrones según el gen. La comparación con Helobdella robusta reveló alta ortología, menor frente a otros anélidos. En embriones tempranos, cerca del 50 % de las innexinas expresadas se detectó en varios tejidos; mediante PCR cuantitativa, cerca del 70 % se expresa en el sistema nervioso. Las neuronas adultas identificadas expresan combinaciones distintas de estos genes.
Contexto
Este estudio reporta la presencia de 21 genes de innexina en el genoma de la sanguijuela medicinal Hirudo verbana, caracterizando sus estructuras génicas, sus relaciones filogenéticas y sus patrones de expresión a lo largo del desarrollo y en neuronas adultas identificadas. Aproximadamente el 70 % de las innexinas se expresan en el sistema nervioso, detectándose diferentes combinaciones en neuronas individuales identificadas, una propiedad que puede sustentar su participación en distintos circuitos de acoplamiento. El trabajo constituye una investigación genómica y neurocientífica sobre Hirudo verbana; el resumen no formula afirmaciones terapéuticas ni relacionadas con el secretoma.
Citación
Referencia (estilo Vancouver)
Kandarian B, Sethi J, Wu A, Baker M, Yazdani N, Kym E, et al. The medicinal leech genome encodes 21 innexin genes: different combinations are expressed by identified central neurons. Dev Genes Evol. 2012;222(1):29-44. doi:10.1007/s00427-011-0387-z. PMID: 22358128
Los datos bibliográficos (autores, volumen, páginas, DOI) proceden del registro de PubMed.
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